Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm14927-201ENSMUST00000120283 454 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 Gm6373-201ENSMUST00000121026 360 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 Gm22204-201ENSMUST00000122654 327 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 Gm6938-201ENSMUST00000123014 771 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 Gm13599-201ENSMUST00000134476 678 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 Crem-222ENSMUST00000144496 978 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 Gm23587-201ENSMUST00000157658 84 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 Gm24965-201ENSMUST00000157922 106 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 Gm23666-201ENSMUST00000158053 116 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 Clec9a-203ENSMUST00000164513 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 Gm20619-202ENSMUST00000176283 1085 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 Gm21809-201ENSMUST00000178495 468 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 Gm17467-201ENSMUST00000178553 468 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 Gm17412-201ENSMUST00000179261 468 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 Gm17577-201ENSMUST00000179916 468 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 1700041C23Rik-201ENSMUST00000185243 395 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 Gm28141-201ENSMUST00000186676 342 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 Gm29408-201ENSMUST00000187536 216 ntBASIC3□□□□□ -1.93
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Ccl20O89093 Gm29558-201ENSMUST00000190134 375 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 Gm37098-201ENSMUST00000192290 244 ntBASIC3□□□□□ -1.93
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Ccl20O89093 Gm38093-201ENSMUST00000195210 710 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 Gm19237-201ENSMUST00000205036 1132 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 Olfr1473-ps1-201ENSMUST00000207135 958 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 AC069561.4-201ENSMUST00000215291 572 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 AC153361.1-201ENSMUST00000219679 247 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 CT571256.1-201ENSMUST00000226045 585 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 Stfa2-201ENSMUST00000023619 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
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Ccl20O89093 Olfr1458-201ENSMUST00000076729 906 ntAPPRIS ALT2 BASIC3□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 4930512M02Rik-201ENSMUST00000081896 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
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Ccl20O89093 Gm23677-201ENSMUST00000083156 104 ntBASIC3□□□□□ -1.93
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Ccl20O89093 Gm10704-201ENSMUST00000098952 730 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 Gm44800-201ENSMUST00000207510 1855 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 Vmn1r89-208ENSMUST00000228587 2061 ntAPPRIS P2 BASIC3□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 2410141K09Rik-202ENSMUST00000172579 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
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Ccl20O89093 Gm27648-201ENSMUST00000184315 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
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Ccl20O89093 Cfh-206ENSMUST00000192880 3746 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 Olfr1298-202ENSMUST00000208284 1563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 Cp-201ENSMUST00000003714 4092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 Olfr1222-202ENSMUST00000214027 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 Skint4-201ENSMUST00000069769 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 Esp31-201ENSMUST00000174742 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 Gm3239-201ENSMUST00000163525 1751 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
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Ccl20O89093 Rpl35-ps1-201ENSMUST00000118070 372 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 Gm12884-201ENSMUST00000120371 325 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 Gm15344-201ENSMUST00000152600 421 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 Gm22310-201ENSMUST00000157509 116 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 Gm16563-201ENSMUST00000162673 423 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 Vmn1r174-201ENSMUST00000167551 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Ccl20O89093 Gm9890-201ENSMUST00000171867 537 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
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