Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 Gm17117-201ENSMUST00000163665 299 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Abcc1O35379 Gm26061-201ENSMUST00000175584 108 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Abcc1O35379 Gm29414-201ENSMUST00000185379 448 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Abcc1O35379 Gm8392-201ENSMUST00000185647 835 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Abcc1O35379 1810044D09Rik-201ENSMUST00000186472 486 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Abcc1O35379 Gm38075-201ENSMUST00000191979 920 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Abcc1O35379 Gm43276-201ENSMUST00000199712 364 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Abcc1O35379 Olfr542-ps1-201ENSMUST00000211706 831 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Abcc1O35379 AC153361.1-201ENSMUST00000219679 247 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Abcc1O35379 Mup5-201ENSMUST00000082287 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Abcc1O35379 Gm34549-201ENSMUST00000207057 1611 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Abcc1O35379 Olfr816-202ENSMUST00000213438 3306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Abcc1O35379 Clhc1-204ENSMUST00000208530 2062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Abcc1O35379 Cd200r3-208ENSMUST00000164007 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Abcc1O35379 Phex-201ENSMUST00000079945 6265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Abcc1O35379 Olfr1056-202ENSMUST00000216547 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Abcc1O35379 Klhl28-203ENSMUST00000222508 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Abcc1O35379 Gm12001-201ENSMUST00000121727 913 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Abcc1O35379 Ighv8-1-201ENSMUST00000194897 291 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Abcc1O35379 Gm43812-201ENSMUST00000200976 581 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Abcc1O35379 Gm35405-201ENSMUST00000218754 400 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Abcc1O35379 Klra7-202ENSMUST00000049304 1075 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Abcc1O35379 Gm22155-201ENSMUST00000083836 162 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Abcc1O35379 Gm26733-201ENSMUST00000180846 2046 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Abcc1O35379 2900092N22Rik-201ENSMUST00000193601 1409 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Abcc1O35379 Mecom-203ENSMUST00000108271 3851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Abcc1O35379 Olfr1111-202ENSMUST00000214492 1616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Abcc1O35379 Dync2h1-204ENSMUST00000140466 14264 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Abcc1O35379 Trav7-2-201ENSMUST00000103636 336 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Abcc1O35379 Gm15021-201ENSMUST00000117832 742 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Abcc1O35379 Gm9208-201ENSMUST00000120468 948 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Abcc1O35379 Sox5it-201ENSMUST00000144026 1207 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Abcc1O35379 Gm22099-201ENSMUST00000157925 123 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Abcc1O35379 Gm22311-201ENSMUST00000158006 110 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Abcc1O35379 Gm9023-201ENSMUST00000198408 1038 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Abcc1O35379 Trav7d-2-201ENSMUST00000200127 337 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Abcc1O35379 AC132384.13-201ENSMUST00000219556 1159 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Abcc1O35379 Prl8a9-201ENSMUST00000006662 942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Abcc1O35379 Olfr969-201ENSMUST00000074566 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Abcc1O35379 Olfr192-201ENSMUST00000080251 925 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Abcc1O35379 Olfr111-203ENSMUST00000215424 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Abcc1O35379 Olfr665-204ENSMUST00000216971 3248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Abcc1O35379 Olfr502-202ENSMUST00000216919 3282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Abcc1O35379 Mgat4c-202ENSMUST00000120748 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Abcc1O35379 Olfr124-202ENSMUST00000215168 4497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Abcc1O35379 Ighv15-2-201ENSMUST00000103497 351 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Abcc1O35379 Gm22782-201ENSMUST00000104082 132 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Abcc1O35379 Gm16327-201ENSMUST00000137146 228 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Abcc1O35379 Gm24720-201ENSMUST00000157518 166 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Abcc1O35379 Gm24816-201ENSMUST00000175311 151 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Abcc1O35379 Trav7-3-201ENSMUST00000177622 402 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Abcc1O35379 Trav7d-3-201ENSMUST00000179789 402 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Abcc1O35379 Gm27188-201ENSMUST00000184383 510 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Abcc1O35379 AC118230.1-201ENSMUST00000220196 656 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Abcc1O35379 Rps15a-ps2-201ENSMUST00000087473 393 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Abcc1O35379 Gm6361-201ENSMUST00000091031 435 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Abcc1O35379 March1-211ENSMUST00000178982 4012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Abcc1O35379 March1-203ENSMUST00000098708 4000 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Abcc1O35379 Olfr1117-ps1-201ENSMUST00000118736 984 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Abcc1O35379 Gm22666-201ENSMUST00000158717 164 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Abcc1O35379 Gm16101-201ENSMUST00000160695 430 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Abcc1O35379 Gm20456-201ENSMUST00000174690 385 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Abcc1O35379 Gm20651-201ENSMUST00000177219 329 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Abcc1O35379 Gm18672-201ENSMUST00000208035 270 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Abcc1O35379 Stard9-207ENSMUST00000180041 15102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Abcc1O35379 Gm18337-201ENSMUST00000219023 5762 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Abcc1O35379 Btla-202ENSMUST00000102802 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Abcc1O35379 Mier1-201ENSMUST00000030247 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Abcc1O35379 Gm28710-202ENSMUST00000211738 2987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Abcc1O35379 Vmn2r-ps57-201ENSMUST00000173861 2598 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
Abcc1O35379 Olfr186-202ENSMUST00000206463 2208 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Abcc1O35379 Gm26522-201ENSMUST00000181565 1555 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Abcc1O35379 4833421K07Rik-201ENSMUST00000206146 1391 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Abcc1O35379 Gm26423-201ENSMUST00000104277 128 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Abcc1O35379 Gm4596-201ENSMUST00000117197 442 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Abcc1O35379 Gm14570-201ENSMUST00000119444 391 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Abcc1O35379 Gm13438-201ENSMUST00000120100 573 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Abcc1O35379 Gm22227-201ENSMUST00000157356 259 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Abcc1O35379 Snord92-201ENSMUST00000175548 85 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Abcc1O35379 Gm17967-201ENSMUST00000195319 647 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Abcc1O35379 Gm8874-201ENSMUST00000196826 286 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Abcc1O35379 Gm17989-201ENSMUST00000211543 412 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Abcc1O35379 AC165164.1-202ENSMUST00000219324 649 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Abcc1O35379 3830406C13Rik-203ENSMUST00000223631 1014 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Abcc1O35379 AC129219.3-201ENSMUST00000223790 196 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Abcc1O35379 Etd-201ENSMUST00000074232 478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Abcc1O35379 Olfr1136-201ENSMUST00000077471 1067 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Abcc1O35379 Ino80d-205ENSMUST00000165066 13529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Abcc1O35379 Abca13-201ENSMUST00000042740 16011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Abcc1O35379 Olfr1161-203ENSMUST00000217006 3647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Abcc1O35379 Gm43259-201ENSMUST00000198446 3277 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Abcc1O35379 Akap6-201ENSMUST00000095737 14847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Abcc1O35379 Syne2-201ENSMUST00000044217 21690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Abcc1O35379 Olfr800-202ENSMUST00000217094 3831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Abcc1O35379 Zfp970-202ENSMUST00000108952 1569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Abcc1O35379 Gm43466-201ENSMUST00000197836 5214 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Abcc1O35379 Gm38269-201ENSMUST00000194549 3298 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Abcc1O35379 Gm12976-202ENSMUST00000153817 412 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Abcc1O35379 Gm22500-201ENSMUST00000158982 99 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Abcc1O35379 4930532M18Rik-201ENSMUST00000187189 481 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.2 ms