Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 5930409G06Rik-201ENSMUST00000192347 1544 ntBASIC2.55□□□□□ -2
MsmbO08540 Gm18529-201ENSMUST00000193025 1257 ntBASIC2.55□□□□□ -2
MsmbO08540 Gm7142-201ENSMUST00000194232 586 ntBASIC2.55□□□□□ -2
MsmbO08540 Gm31942-202ENSMUST00000195375 437 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
MsmbO08540 Gm9023-201ENSMUST00000198408 1038 ntBASIC2.55□□□□□ -2
MsmbO08540 Gm19039-201ENSMUST00000204363 575 ntBASIC2.55□□□□□ -2
MsmbO08540 1700065L07Rik-201ENSMUST00000204961 614 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
MsmbO08540 Olfr194-202ENSMUST00000213228 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
MsmbO08540 Olfr665-204ENSMUST00000216971 3248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
MsmbO08540 AC154467.1-201ENSMUST00000227527 449 ntBASIC2.55□□□□□ -2
MsmbO08540 Olfr1442-201ENSMUST00000057924 1065 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
MsmbO08540 Etd-201ENSMUST00000074232 478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
MsmbO08540 Rps17-201ENSMUST00000080813 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
MsmbO08540 Olfr728-202ENSMUST00000213685 7087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
MsmbO08540 Vmn1r22-202ENSMUST00000227650 3674 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
MsmbO08540 Gm35835-202ENSMUST00000216984 3350 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
MsmbO08540 B020011L13Rik-201ENSMUST00000188801 2879 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
MsmbO08540 Zfp433-201ENSMUST00000085664 1800 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
MsmbO08540 Gm43665-201ENSMUST00000198672 1659 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MsmbO08540 Gm45809-201ENSMUST00000211661 3894 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MsmbO08540 Prl2c2-201ENSMUST00000110594 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
MsmbO08540 Gm13873-201ENSMUST00000119208 427 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MsmbO08540 Gm6762-201ENSMUST00000121769 289 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MsmbO08540 1700119I11Rik-201ENSMUST00000122270 336 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
MsmbO08540 Gm2892-201ENSMUST00000145537 711 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MsmbO08540 Etaa1os-202ENSMUST00000148496 388 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
MsmbO08540 Gm23441-201ENSMUST00000157268 127 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MsmbO08540 Gm22722-201ENSMUST00000157467 132 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MsmbO08540 Gm26187-201ENSMUST00000157693 101 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MsmbO08540 Gm25669-201ENSMUST00000157699 112 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MsmbO08540 Gm22730-201ENSMUST00000158085 171 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MsmbO08540 Gm26354-201ENSMUST00000158221 129 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MsmbO08540 Gm22833-201ENSMUST00000158292 132 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MsmbO08540 Gm23028-201ENSMUST00000158773 265 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MsmbO08540 Gm20468-201ENSMUST00000172664 452 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
MsmbO08540 Rfpl4b-201ENSMUST00000179279 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
MsmbO08540 Gm29554-201ENSMUST00000187922 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
MsmbO08540 Gm28069-201ENSMUST00000189926 214 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MsmbO08540 Gm20162-201ENSMUST00000193629 871 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MsmbO08540 4930558F17Rik-201ENSMUST00000197789 786 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
MsmbO08540 Gm43640-201ENSMUST00000199000 786 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
MsmbO08540 Gm33847-201ENSMUST00000199294 786 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
MsmbO08540 Gm43492-201ENSMUST00000199522 786 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
MsmbO08540 4930595O18Rik-201ENSMUST00000205099 607 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MsmbO08540 Olfr206-202ENSMUST00000207927 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
MsmbO08540 Gm33501-201ENSMUST00000209257 1193 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
MsmbO08540 AC093926.1-201ENSMUST00000213730 243 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MsmbO08540 Gm18585-201ENSMUST00000215197 556 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MsmbO08540 4930545L08Rik-201ENSMUST00000215688 566 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
MsmbO08540 Gm19987-201ENSMUST00000216339 499 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MsmbO08540 3110043J17Rik-201ENSMUST00000219153 760 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MsmbO08540 Pah-204ENSMUST00000219813 789 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
MsmbO08540 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MsmbO08540 CT030194.2-201ENSMUST00000225752 379 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MsmbO08540 4930568D16Rik-201ENSMUST00000028243 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
MsmbO08540 Olfr855-201ENSMUST00000061693 992 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
MsmbO08540 Olfr767-201ENSMUST00000082131 1086 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
MsmbO08540 Gm26072-201ENSMUST00000083135 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MsmbO08540 Olfr358-202ENSMUST00000216437 4962 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
MsmbO08540 Olfr1484-202ENSMUST00000208104 3621 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
MsmbO08540 Olfr1484-206ENSMUST00000217451 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
MsmbO08540 Olfr1251-202ENSMUST00000214639 3071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
MsmbO08540 Olfr1318-205ENSMUST00000217533 3747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
MsmbO08540 Gm36927-201ENSMUST00000192504 1841 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MsmbO08540 AC158921.1-201ENSMUST00000227861 3468 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MsmbO08540 Olfr839-ps1-201ENSMUST00000212127 7759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
MsmbO08540 Zfp273-203ENSMUST00000181391 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
MsmbO08540 Gm5590-202ENSMUST00000186976 2315 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
MsmbO08540 Vmn2r82-201ENSMUST00000170596 3045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
MsmbO08540 Olfr1461-202ENSMUST00000207113 3481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
MsmbO08540 Olfr1274-ps-202ENSMUST00000216111 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
MsmbO08540 AC154634.4-201ENSMUST00000226077 2665 ntBASIC2.53□□□□□ -2
MsmbO08540 Olfr1150-ps1-201ENSMUST00000121186 3311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
MsmbO08540 Gm42537-201ENSMUST00000198260 2574 ntBASIC2.53□□□□□ -2
MsmbO08540 Samt2-201ENSMUST00000101137 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
MsmbO08540 Smim9-201ENSMUST00000101433 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
MsmbO08540 Gm23424-201ENSMUST00000103889 110 ntBASIC2.53□□□□□ -2
MsmbO08540 Gm22936-201ENSMUST00000103955 126 ntBASIC2.53□□□□□ -2
MsmbO08540 Gm24118-201ENSMUST00000103972 126 ntBASIC2.53□□□□□ -2
MsmbO08540 Gm23747-201ENSMUST00000104228 131 ntBASIC2.53□□□□□ -2
MsmbO08540 Gm15142-201ENSMUST00000121013 856 ntBASIC2.53□□□□□ -2
MsmbO08540 Gm21814-201ENSMUST00000144085 291 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
MsmbO08540 Gm22226-201ENSMUST00000157355 109 ntBASIC2.53□□□□□ -2
MsmbO08540 Gm26045-201ENSMUST00000157862 97 ntBASIC2.53□□□□□ -2
MsmbO08540 Gm26088-201ENSMUST00000157896 131 ntBASIC2.53□□□□□ -2
MsmbO08540 Gm23116-201ENSMUST00000158481 67 ntBASIC2.53□□□□□ -2
MsmbO08540 Gm25490-201ENSMUST00000158734 130 ntBASIC2.53□□□□□ -2
MsmbO08540 Gm24819-201ENSMUST00000175094 166 ntBASIC2.53□□□□□ -2
MsmbO08540 Gm28785-201ENSMUST00000187478 379 ntBASIC2.53□□□□□ -2
MsmbO08540 1700010H22Rik-202ENSMUST00000187592 1003 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
MsmbO08540 Gm37081-201ENSMUST00000192034 196 ntBASIC2.53□□□□□ -2
MsmbO08540 Gm13266-203ENSMUST00000193364 421 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
MsmbO08540 Gm43525-201ENSMUST00000196460 616 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
MsmbO08540 Tprkb-214ENSMUST00000202803 716 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
MsmbO08540 Gm44649-201ENSMUST00000205608 364 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
MsmbO08540 Gm20074-201ENSMUST00000208144 484 ntBASIC2.53□□□□□ -2
MsmbO08540 Gm44808-201ENSMUST00000208887 264 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
MsmbO08540 Gm18899-201ENSMUST00000217663 546 ntBASIC2.53□□□□□ -2
MsmbO08540 AC147615.1-201ENSMUST00000218914 441 ntBASIC2.53□□□□□ -2
MsmbO08540 AC154562.1-201ENSMUST00000226140 966 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.4 ms