Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Speer3W4VSP1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Speer3W4VSP1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Speer3W4VSP1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Speer3W4VSP1 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Speer3W4VSP1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Speer3W4VSP1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Speer3W4VSP1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Speer3W4VSP1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Speer3W4VSP1 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Speer3W4VSP1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Speer3W4VSP1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Speer3W4VSP1 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Speer3W4VSP1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Speer3W4VSP1 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Speer3W4VSP1 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Speer3W4VSP1 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Speer3W4VSP1 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Speer3W4VSP1 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Speer3W4VSP1 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Speer3W4VSP1 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Speer3W4VSP1 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Speer3W4VSP1 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Speer3W4VSP1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Speer3W4VSP1 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Speer3W4VSP1 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Speer3W4VSP1 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Speer3W4VSP1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Speer3W4VSP1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Speer3W4VSP1 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Speer3W4VSP1 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Speer3W4VSP1 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Speer3W4VSP1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Speer3W4VSP1 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Speer3W4VSP1 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Speer3W4VSP1 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Speer3W4VSP1 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Speer3W4VSP1 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Speer3W4VSP1 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Speer3W4VSP1 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Speer3W4VSP1 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Speer3W4VSP1 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Speer3W4VSP1 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Speer3W4VSP1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Speer3W4VSP1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Speer3W4VSP1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Speer3W4VSP1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Speer3W4VSP1 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Speer3W4VSP1 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Speer3W4VSP1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Speer3W4VSP1 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Speer3W4VSP1 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Speer3W4VSP1 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Speer3W4VSP1 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Speer3W4VSP1 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Speer3W4VSP1 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Speer3W4VSP1 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Speer3W4VSP1 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Speer3W4VSP1 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Speer3W4VSP1 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Speer3W4VSP1 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Speer3W4VSP1 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Speer3W4VSP1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Speer3W4VSP1 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Speer3W4VSP1 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Speer3W4VSP1 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Speer3W4VSP1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Speer3W4VSP1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Speer3W4VSP1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Speer3W4VSP1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Speer3W4VSP1 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Speer3W4VSP1 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Speer3W4VSP1 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Speer3W4VSP1 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Speer3W4VSP1 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Speer3W4VSP1 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Speer3W4VSP1 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Speer3W4VSP1 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Speer3W4VSP1 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Speer3W4VSP1 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Speer3W4VSP1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Speer3W4VSP1 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Speer3W4VSP1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Speer3W4VSP1 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Speer3W4VSP1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Speer3W4VSP1 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Speer3W4VSP1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Speer3W4VSP1 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Speer3W4VSP1 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Speer3W4VSP1 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Speer3W4VSP1 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Speer3W4VSP1 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Speer3W4VSP1 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Speer3W4VSP1 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Speer3W4VSP1 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Speer3W4VSP1 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Speer3W4VSP1 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Speer3W4VSP1 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Speer3W4VSP1 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Speer3W4VSP1 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms