Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Top3bQ9Z321 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Top3bQ9Z321 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Top3bQ9Z321 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Top3bQ9Z321 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Top3bQ9Z321 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Top3bQ9Z321 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Top3bQ9Z321 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Top3bQ9Z321 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Top3bQ9Z321 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Top3bQ9Z321 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Top3bQ9Z321 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Top3bQ9Z321 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Top3bQ9Z321 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Top3bQ9Z321 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Top3bQ9Z321 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Top3bQ9Z321 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Top3bQ9Z321 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Top3bQ9Z321 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Top3bQ9Z321 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Top3bQ9Z321 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Top3bQ9Z321 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Top3bQ9Z321 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Top3bQ9Z321 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Top3bQ9Z321 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Top3bQ9Z321 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Top3bQ9Z321 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Top3bQ9Z321 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Top3bQ9Z321 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Top3bQ9Z321 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Top3bQ9Z321 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Top3bQ9Z321 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Top3bQ9Z321 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Top3bQ9Z321 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Top3bQ9Z321 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Top3bQ9Z321 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Top3bQ9Z321 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Top3bQ9Z321 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Top3bQ9Z321 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Top3bQ9Z321 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Top3bQ9Z321 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Top3bQ9Z321 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Top3bQ9Z321 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Top3bQ9Z321 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Top3bQ9Z321 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Top3bQ9Z321 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Top3bQ9Z321 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Top3bQ9Z321 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Top3bQ9Z321 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Top3bQ9Z321 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Top3bQ9Z321 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Top3bQ9Z321 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Top3bQ9Z321 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Top3bQ9Z321 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Top3bQ9Z321 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Top3bQ9Z321 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Top3bQ9Z321 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Top3bQ9Z321 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Top3bQ9Z321 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Top3bQ9Z321 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Top3bQ9Z321 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Top3bQ9Z321 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Top3bQ9Z321 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Top3bQ9Z321 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Top3bQ9Z321 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Top3bQ9Z321 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Top3bQ9Z321 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Top3bQ9Z321 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Top3bQ9Z321 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Top3bQ9Z321 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Top3bQ9Z321 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Top3bQ9Z321 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Top3bQ9Z321 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Top3bQ9Z321 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Top3bQ9Z321 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Top3bQ9Z321 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Top3bQ9Z321 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Top3bQ9Z321 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Top3bQ9Z321 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Top3bQ9Z321 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Top3bQ9Z321 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Top3bQ9Z321 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Top3bQ9Z321 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Top3bQ9Z321 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Top3bQ9Z321 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Top3bQ9Z321 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Top3bQ9Z321 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Top3bQ9Z321 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Top3bQ9Z321 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Top3bQ9Z321 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Top3bQ9Z321 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Top3bQ9Z321 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Top3bQ9Z321 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Top3bQ9Z321 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Top3bQ9Z321 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Top3bQ9Z321 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Top3bQ9Z321 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Top3bQ9Z321 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Top3bQ9Z321 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Top3bQ9Z321 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms