Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt27Q9Z320 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt27Q9Z320 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt27Q9Z320 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt27Q9Z320 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt27Q9Z320 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt27Q9Z320 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt27Q9Z320 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt27Q9Z320 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt27Q9Z320 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt27Q9Z320 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt27Q9Z320 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt27Q9Z320 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt27Q9Z320 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt27Q9Z320 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt27Q9Z320 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt27Q9Z320 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt27Q9Z320 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt27Q9Z320 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt27Q9Z320 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt27Q9Z320 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt27Q9Z320 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt27Q9Z320 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt27Q9Z320 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt27Q9Z320 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt27Q9Z320 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt27Q9Z320 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt27Q9Z320 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt27Q9Z320 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt27Q9Z320 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt27Q9Z320 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt27Q9Z320 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt27Q9Z320 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt27Q9Z320 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt27Q9Z320 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt27Q9Z320 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt27Q9Z320 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt27Q9Z320 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt27Q9Z320 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt27Q9Z320 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt27Q9Z320 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt27Q9Z320 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt27Q9Z320 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt27Q9Z320 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt27Q9Z320 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt27Q9Z320 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt27Q9Z320 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt27Q9Z320 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt27Q9Z320 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt27Q9Z320 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt27Q9Z320 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt27Q9Z320 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt27Q9Z320 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt27Q9Z320 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt27Q9Z320 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt27Q9Z320 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt27Q9Z320 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt27Q9Z320 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt27Q9Z320 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt27Q9Z320 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt27Q9Z320 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt27Q9Z320 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt27Q9Z320 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt27Q9Z320 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt27Q9Z320 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt27Q9Z320 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt27Q9Z320 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt27Q9Z320 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt27Q9Z320 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt27Q9Z320 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt27Q9Z320 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt27Q9Z320 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt27Q9Z320 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt27Q9Z320 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt27Q9Z320 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt27Q9Z320 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt27Q9Z320 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt27Q9Z320 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Krt27Q9Z320 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Krt27Q9Z320 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Krt27Q9Z320 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Krt27Q9Z320 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Krt27Q9Z320 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt27Q9Z320 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt27Q9Z320 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt27Q9Z320 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt27Q9Z320 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt27Q9Z320 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt27Q9Z320 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt27Q9Z320 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt27Q9Z320 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt27Q9Z320 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt27Q9Z320 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt27Q9Z320 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt27Q9Z320 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt27Q9Z320 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt27Q9Z320 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt27Q9Z320 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt27Q9Z320 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt27Q9Z320 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms