Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hdac5Q9Z2V6 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hdac5Q9Z2V6 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hdac5Q9Z2V6 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hdac5Q9Z2V6 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hdac5Q9Z2V6 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hdac5Q9Z2V6 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hdac5Q9Z2V6 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hdac5Q9Z2V6 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hdac5Q9Z2V6 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Hdac5Q9Z2V6 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hdac5Q9Z2V6 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hdac5Q9Z2V6 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hdac5Q9Z2V6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.56
Hdac5Q9Z2V6 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hdac5Q9Z2V6 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hdac5Q9Z2V6 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hdac5Q9Z2V6 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hdac5Q9Z2V6 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hdac5Q9Z2V6 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hdac5Q9Z2V6 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hdac5Q9Z2V6 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hdac5Q9Z2V6 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hdac5Q9Z2V6 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hdac5Q9Z2V6 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hdac5Q9Z2V6 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hdac5Q9Z2V6 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hdac5Q9Z2V6 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hdac5Q9Z2V6 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hdac5Q9Z2V6 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hdac5Q9Z2V6 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hdac5Q9Z2V6 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hdac5Q9Z2V6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hdac5Q9Z2V6 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hdac5Q9Z2V6 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hdac5Q9Z2V6 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hdac5Q9Z2V6 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hdac5Q9Z2V6 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hdac5Q9Z2V6 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hdac5Q9Z2V6 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hdac5Q9Z2V6 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hdac5Q9Z2V6 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Hdac5Q9Z2V6 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hdac5Q9Z2V6 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Hdac5Q9Z2V6 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hdac5Q9Z2V6 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hdac5Q9Z2V6 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hdac5Q9Z2V6 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hdac5Q9Z2V6 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hdac5Q9Z2V6 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hdac5Q9Z2V6 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hdac5Q9Z2V6 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hdac5Q9Z2V6 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hdac5Q9Z2V6 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hdac5Q9Z2V6 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hdac5Q9Z2V6 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hdac5Q9Z2V6 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hdac5Q9Z2V6 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hdac5Q9Z2V6 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hdac5Q9Z2V6 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hdac5Q9Z2V6 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hdac5Q9Z2V6 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hdac5Q9Z2V6 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hdac5Q9Z2V6 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hdac5Q9Z2V6 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hdac5Q9Z2V6 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hdac5Q9Z2V6 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hdac5Q9Z2V6 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hdac5Q9Z2V6 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hdac5Q9Z2V6 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hdac5Q9Z2V6 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hdac5Q9Z2V6 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hdac5Q9Z2V6 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hdac5Q9Z2V6 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hdac5Q9Z2V6 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hdac5Q9Z2V6 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hdac5Q9Z2V6 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hdac5Q9Z2V6 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hdac5Q9Z2V6 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hdac5Q9Z2V6 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hdac5Q9Z2V6 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hdac5Q9Z2V6 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hdac5Q9Z2V6 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Hdac5Q9Z2V6 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hdac5Q9Z2V6 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Hdac5Q9Z2V6 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hdac5Q9Z2V6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hdac5Q9Z2V6 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hdac5Q9Z2V6 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hdac5Q9Z2V6 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hdac5Q9Z2V6 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hdac5Q9Z2V6 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hdac5Q9Z2V6 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hdac5Q9Z2V6 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hdac5Q9Z2V6 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hdac5Q9Z2V6 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hdac5Q9Z2V6 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hdac5Q9Z2V6 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hdac5Q9Z2V6 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hdac5Q9Z2V6 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
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