Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2T6

Krt85, Keratin, type II cuticular Hb5, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt85Q9Z2T6 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt85Q9Z2T6 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt85Q9Z2T6 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt85Q9Z2T6 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt85Q9Z2T6 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt85Q9Z2T6 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt85Q9Z2T6 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt85Q9Z2T6 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt85Q9Z2T6 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt85Q9Z2T6 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt85Q9Z2T6 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt85Q9Z2T6 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt85Q9Z2T6 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt85Q9Z2T6 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt85Q9Z2T6 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt85Q9Z2T6 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt85Q9Z2T6 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt85Q9Z2T6 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt85Q9Z2T6 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt85Q9Z2T6 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt85Q9Z2T6 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt85Q9Z2T6 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt85Q9Z2T6 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt85Q9Z2T6 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt85Q9Z2T6 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt85Q9Z2T6 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt85Q9Z2T6 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt85Q9Z2T6 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt85Q9Z2T6 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt85Q9Z2T6 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt85Q9Z2T6 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt85Q9Z2T6 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt85Q9Z2T6 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt85Q9Z2T6 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt85Q9Z2T6 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt85Q9Z2T6 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt85Q9Z2T6 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt85Q9Z2T6 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt85Q9Z2T6 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt85Q9Z2T6 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt85Q9Z2T6 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt85Q9Z2T6 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt85Q9Z2T6 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt85Q9Z2T6 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt85Q9Z2T6 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt85Q9Z2T6 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt85Q9Z2T6 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt85Q9Z2T6 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt85Q9Z2T6 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt85Q9Z2T6 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt85Q9Z2T6 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt85Q9Z2T6 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt85Q9Z2T6 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt85Q9Z2T6 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt85Q9Z2T6 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt85Q9Z2T6 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt85Q9Z2T6 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt85Q9Z2T6 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Krt85Q9Z2T6 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Krt85Q9Z2T6 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Krt85Q9Z2T6 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Krt85Q9Z2T6 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Krt85Q9Z2T6 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Krt85Q9Z2T6 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Krt85Q9Z2T6 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Krt85Q9Z2T6 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Krt85Q9Z2T6 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Krt85Q9Z2T6 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Krt85Q9Z2T6 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Krt85Q9Z2T6 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Krt85Q9Z2T6 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt85Q9Z2T6 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt85Q9Z2T6 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt85Q9Z2T6 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt85Q9Z2T6 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt85Q9Z2T6 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt85Q9Z2T6 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt85Q9Z2T6 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt85Q9Z2T6 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt85Q9Z2T6 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt85Q9Z2T6 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt85Q9Z2T6 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt85Q9Z2T6 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt85Q9Z2T6 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt85Q9Z2T6 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt85Q9Z2T6 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt85Q9Z2T6 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt85Q9Z2T6 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt85Q9Z2T6 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt85Q9Z2T6 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt85Q9Z2T6 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt85Q9Z2T6 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt85Q9Z2T6 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt85Q9Z2T6 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt85Q9Z2T6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt85Q9Z2T6 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt85Q9Z2T6 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt85Q9Z2T6 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt85Q9Z2T6 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt85Q9Z2T6 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms