Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2H7

Gipc2, PDZ domain-containing protein GIPC2, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gipc2Q9Z2H7 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gipc2Q9Z2H7 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gipc2Q9Z2H7 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gipc2Q9Z2H7 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gipc2Q9Z2H7 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gipc2Q9Z2H7 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gipc2Q9Z2H7 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gipc2Q9Z2H7 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gipc2Q9Z2H7 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gipc2Q9Z2H7 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gipc2Q9Z2H7 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gipc2Q9Z2H7 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gipc2Q9Z2H7 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gipc2Q9Z2H7 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gipc2Q9Z2H7 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gipc2Q9Z2H7 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gipc2Q9Z2H7 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gipc2Q9Z2H7 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gipc2Q9Z2H7 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gipc2Q9Z2H7 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gipc2Q9Z2H7 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gipc2Q9Z2H7 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gipc2Q9Z2H7 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gipc2Q9Z2H7 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gipc2Q9Z2H7 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gipc2Q9Z2H7 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gipc2Q9Z2H7 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gipc2Q9Z2H7 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gipc2Q9Z2H7 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gipc2Q9Z2H7 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gipc2Q9Z2H7 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gipc2Q9Z2H7 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gipc2Q9Z2H7 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gipc2Q9Z2H7 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gipc2Q9Z2H7 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gipc2Q9Z2H7 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gipc2Q9Z2H7 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gipc2Q9Z2H7 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gipc2Q9Z2H7 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gipc2Q9Z2H7 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gipc2Q9Z2H7 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gipc2Q9Z2H7 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gipc2Q9Z2H7 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gipc2Q9Z2H7 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gipc2Q9Z2H7 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gipc2Q9Z2H7 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gipc2Q9Z2H7 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gipc2Q9Z2H7 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gipc2Q9Z2H7 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gipc2Q9Z2H7 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gipc2Q9Z2H7 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gipc2Q9Z2H7 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gipc2Q9Z2H7 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gipc2Q9Z2H7 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gipc2Q9Z2H7 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gipc2Q9Z2H7 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gipc2Q9Z2H7 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gipc2Q9Z2H7 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gipc2Q9Z2H7 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gipc2Q9Z2H7 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gipc2Q9Z2H7 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gipc2Q9Z2H7 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gipc2Q9Z2H7 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gipc2Q9Z2H7 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gipc2Q9Z2H7 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gipc2Q9Z2H7 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gipc2Q9Z2H7 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gipc2Q9Z2H7 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gipc2Q9Z2H7 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gipc2Q9Z2H7 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gipc2Q9Z2H7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gipc2Q9Z2H7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gipc2Q9Z2H7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gipc2Q9Z2H7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gipc2Q9Z2H7 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gipc2Q9Z2H7 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gipc2Q9Z2H7 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gipc2Q9Z2H7 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gipc2Q9Z2H7 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gipc2Q9Z2H7 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gipc2Q9Z2H7 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gipc2Q9Z2H7 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gipc2Q9Z2H7 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gipc2Q9Z2H7 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gipc2Q9Z2H7 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gipc2Q9Z2H7 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gipc2Q9Z2H7 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gipc2Q9Z2H7 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gipc2Q9Z2H7 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gipc2Q9Z2H7 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gipc2Q9Z2H7 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gipc2Q9Z2H7 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gipc2Q9Z2H7 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gipc2Q9Z2H7 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gipc2Q9Z2H7 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gipc2Q9Z2H7 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gipc2Q9Z2H7 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gipc2Q9Z2H7 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gipc2Q9Z2H7 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gipc2Q9Z2H7 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms