Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D7

Mbd4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd4Q9Z2D7 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Mbd4Q9Z2D7 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Mbd4Q9Z2D7 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Mbd4Q9Z2D7 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Mbd4Q9Z2D7 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Mbd4Q9Z2D7 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Mbd4Q9Z2D7 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Mbd4Q9Z2D7 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mbd4Q9Z2D7 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mbd4Q9Z2D7 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mbd4Q9Z2D7 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mbd4Q9Z2D7 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mbd4Q9Z2D7 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mbd4Q9Z2D7 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mbd4Q9Z2D7 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mbd4Q9Z2D7 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mbd4Q9Z2D7 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mbd4Q9Z2D7 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mbd4Q9Z2D7 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mbd4Q9Z2D7 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mbd4Q9Z2D7 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Mbd4Q9Z2D7 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mbd4Q9Z2D7 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Mbd4Q9Z2D7 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mbd4Q9Z2D7 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mbd4Q9Z2D7 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mbd4Q9Z2D7 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mbd4Q9Z2D7 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Mbd4Q9Z2D7 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mbd4Q9Z2D7 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mbd4Q9Z2D7 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mbd4Q9Z2D7 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mbd4Q9Z2D7 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mbd4Q9Z2D7 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mbd4Q9Z2D7 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mbd4Q9Z2D7 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Mbd4Q9Z2D7 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mbd4Q9Z2D7 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mbd4Q9Z2D7 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mbd4Q9Z2D7 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mbd4Q9Z2D7 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mbd4Q9Z2D7 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mbd4Q9Z2D7 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mbd4Q9Z2D7 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Mbd4Q9Z2D7 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mbd4Q9Z2D7 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mbd4Q9Z2D7 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mbd4Q9Z2D7 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mbd4Q9Z2D7 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mbd4Q9Z2D7 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mbd4Q9Z2D7 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mbd4Q9Z2D7 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mbd4Q9Z2D7 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd4Q9Z2D7 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd4Q9Z2D7 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd4Q9Z2D7 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd4Q9Z2D7 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd4Q9Z2D7 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd4Q9Z2D7 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd4Q9Z2D7 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd4Q9Z2D7 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd4Q9Z2D7 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd4Q9Z2D7 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd4Q9Z2D7 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd4Q9Z2D7 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd4Q9Z2D7 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd4Q9Z2D7 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd4Q9Z2D7 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd4Q9Z2D7 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd4Q9Z2D7 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd4Q9Z2D7 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd4Q9Z2D7 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd4Q9Z2D7 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd4Q9Z2D7 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd4Q9Z2D7 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd4Q9Z2D7 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd4Q9Z2D7 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd4Q9Z2D7 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mbd4Q9Z2D7 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mbd4Q9Z2D7 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mbd4Q9Z2D7 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mbd4Q9Z2D7 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mbd4Q9Z2D7 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mbd4Q9Z2D7 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mbd4Q9Z2D7 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mbd4Q9Z2D7 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Mbd4Q9Z2D7 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mbd4Q9Z2D7 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mbd4Q9Z2D7 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Mbd4Q9Z2D7 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mbd4Q9Z2D7 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mbd4Q9Z2D7 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mbd4Q9Z2D7 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mbd4Q9Z2D7 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mbd4Q9Z2D7 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Mbd4Q9Z2D7 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mbd4Q9Z2D7 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mbd4Q9Z2D7 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mbd4Q9Z2D7 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mbd4Q9Z2D7 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms