Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2B9

Rps6ka4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka4Q9Z2B9 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rps6ka4Q9Z2B9 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rps6ka4Q9Z2B9 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rps6ka4Q9Z2B9 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rps6ka4Q9Z2B9 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rps6ka4Q9Z2B9 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rps6ka4Q9Z2B9 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rps6ka4Q9Z2B9 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Rps6ka4Q9Z2B9 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rps6ka4Q9Z2B9 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rps6ka4Q9Z2B9 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rps6ka4Q9Z2B9 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rps6ka4Q9Z2B9 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rps6ka4Q9Z2B9 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rps6ka4Q9Z2B9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rps6ka4Q9Z2B9 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rps6ka4Q9Z2B9 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rps6ka4Q9Z2B9 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rps6ka4Q9Z2B9 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rps6ka4Q9Z2B9 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Rps6ka4Q9Z2B9 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rps6ka4Q9Z2B9 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rps6ka4Q9Z2B9 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Rps6ka4Q9Z2B9 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rps6ka4Q9Z2B9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rps6ka4Q9Z2B9 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rps6ka4Q9Z2B9 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rps6ka4Q9Z2B9 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Rps6ka4Q9Z2B9 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rps6ka4Q9Z2B9 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rps6ka4Q9Z2B9 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rps6ka4Q9Z2B9 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rps6ka4Q9Z2B9 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rps6ka4Q9Z2B9 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rps6ka4Q9Z2B9 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rps6ka4Q9Z2B9 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rps6ka4Q9Z2B9 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rps6ka4Q9Z2B9 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rps6ka4Q9Z2B9 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rps6ka4Q9Z2B9 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rps6ka4Q9Z2B9 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rps6ka4Q9Z2B9 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rps6ka4Q9Z2B9 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Rps6ka4Q9Z2B9 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rps6ka4Q9Z2B9 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rps6ka4Q9Z2B9 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rps6ka4Q9Z2B9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rps6ka4Q9Z2B9 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rps6ka4Q9Z2B9 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rps6ka4Q9Z2B9 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rps6ka4Q9Z2B9 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rps6ka4Q9Z2B9 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Rps6ka4Q9Z2B9 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rps6ka4Q9Z2B9 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rps6ka4Q9Z2B9 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rps6ka4Q9Z2B9 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rps6ka4Q9Z2B9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rps6ka4Q9Z2B9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rps6ka4Q9Z2B9 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rps6ka4Q9Z2B9 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rps6ka4Q9Z2B9 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rps6ka4Q9Z2B9 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rps6ka4Q9Z2B9 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Rps6ka4Q9Z2B9 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Rps6ka4Q9Z2B9 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rps6ka4Q9Z2B9 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rps6ka4Q9Z2B9 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rps6ka4Q9Z2B9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rps6ka4Q9Z2B9 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rps6ka4Q9Z2B9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rps6ka4Q9Z2B9 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rps6ka4Q9Z2B9 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rps6ka4Q9Z2B9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rps6ka4Q9Z2B9 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rps6ka4Q9Z2B9 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rps6ka4Q9Z2B9 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Rps6ka4Q9Z2B9 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rps6ka4Q9Z2B9 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Rps6ka4Q9Z2B9 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rps6ka4Q9Z2B9 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rps6ka4Q9Z2B9 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rps6ka4Q9Z2B9 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rps6ka4Q9Z2B9 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms