Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn8Q9Z260 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn8Q9Z260 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn8Q9Z260 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn8Q9Z260 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn8Q9Z260 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn8Q9Z260 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn8Q9Z260 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn8Q9Z260 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn8Q9Z260 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn8Q9Z260 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn8Q9Z260 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn8Q9Z260 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn8Q9Z260 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn8Q9Z260 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn8Q9Z260 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn8Q9Z260 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn8Q9Z260 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn8Q9Z260 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn8Q9Z260 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn8Q9Z260 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn8Q9Z260 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn8Q9Z260 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn8Q9Z260 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn8Q9Z260 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn8Q9Z260 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn8Q9Z260 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn8Q9Z260 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn8Q9Z260 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn8Q9Z260 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn8Q9Z260 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn8Q9Z260 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn8Q9Z260 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn8Q9Z260 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn8Q9Z260 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn8Q9Z260 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn8Q9Z260 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn8Q9Z260 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn8Q9Z260 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn8Q9Z260 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn8Q9Z260 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn8Q9Z260 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn8Q9Z260 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn8Q9Z260 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn8Q9Z260 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn8Q9Z260 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn8Q9Z260 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn8Q9Z260 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn8Q9Z260 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn8Q9Z260 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn8Q9Z260 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn8Q9Z260 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn8Q9Z260 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn8Q9Z260 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn8Q9Z260 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn8Q9Z260 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn8Q9Z260 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn8Q9Z260 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn8Q9Z260 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn8Q9Z260 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn8Q9Z260 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn8Q9Z260 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn8Q9Z260 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn8Q9Z260 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn8Q9Z260 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn8Q9Z260 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn8Q9Z260 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn8Q9Z260 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn8Q9Z260 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn8Q9Z260 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn8Q9Z260 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn8Q9Z260 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn8Q9Z260 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn8Q9Z260 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn8Q9Z260 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn8Q9Z260 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn8Q9Z260 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn8Q9Z260 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn8Q9Z260 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn8Q9Z260 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn8Q9Z260 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn8Q9Z260 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn8Q9Z260 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn8Q9Z260 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn8Q9Z260 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn8Q9Z260 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn8Q9Z260 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn8Q9Z260 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn8Q9Z260 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn8Q9Z260 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn8Q9Z260 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn8Q9Z260 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn8Q9Z260 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn8Q9Z260 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn8Q9Z260 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn8Q9Z260 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn8Q9Z260 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn8Q9Z260 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn8Q9Z260 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cldn8Q9Z260 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms