Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trip6Q9Z1Y4 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trip6Q9Z1Y4 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trip6Q9Z1Y4 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trip6Q9Z1Y4 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trip6Q9Z1Y4 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trip6Q9Z1Y4 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trip6Q9Z1Y4 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trip6Q9Z1Y4 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Trip6Q9Z1Y4 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trip6Q9Z1Y4 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trip6Q9Z1Y4 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trip6Q9Z1Y4 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trip6Q9Z1Y4 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trip6Q9Z1Y4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trip6Q9Z1Y4 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trip6Q9Z1Y4 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trip6Q9Z1Y4 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trip6Q9Z1Y4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trip6Q9Z1Y4 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trip6Q9Z1Y4 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trip6Q9Z1Y4 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trip6Q9Z1Y4 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trip6Q9Z1Y4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trip6Q9Z1Y4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trip6Q9Z1Y4 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trip6Q9Z1Y4 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trip6Q9Z1Y4 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trip6Q9Z1Y4 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trip6Q9Z1Y4 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trip6Q9Z1Y4 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trip6Q9Z1Y4 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trip6Q9Z1Y4 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trip6Q9Z1Y4 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trip6Q9Z1Y4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trip6Q9Z1Y4 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trip6Q9Z1Y4 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trip6Q9Z1Y4 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trip6Q9Z1Y4 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trip6Q9Z1Y4 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trip6Q9Z1Y4 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trip6Q9Z1Y4 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trip6Q9Z1Y4 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trip6Q9Z1Y4 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trip6Q9Z1Y4 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Trip6Q9Z1Y4 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Trip6Q9Z1Y4 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Trip6Q9Z1Y4 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trip6Q9Z1Y4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trip6Q9Z1Y4 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trip6Q9Z1Y4 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trip6Q9Z1Y4 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trip6Q9Z1Y4 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trip6Q9Z1Y4 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trip6Q9Z1Y4 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trip6Q9Z1Y4 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trip6Q9Z1Y4 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Trip6Q9Z1Y4 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trip6Q9Z1Y4 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Trip6Q9Z1Y4 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trip6Q9Z1Y4 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Trip6Q9Z1Y4 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trip6Q9Z1Y4 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Trip6Q9Z1Y4 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trip6Q9Z1Y4 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Trip6Q9Z1Y4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trip6Q9Z1Y4 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Trip6Q9Z1Y4 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trip6Q9Z1Y4 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trip6Q9Z1Y4 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trip6Q9Z1Y4 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Trip6Q9Z1Y4 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trip6Q9Z1Y4 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trip6Q9Z1Y4 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trip6Q9Z1Y4 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Trip6Q9Z1Y4 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Trip6Q9Z1Y4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trip6Q9Z1Y4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trip6Q9Z1Y4 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trip6Q9Z1Y4 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Trip6Q9Z1Y4 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Trip6Q9Z1Y4 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Trip6Q9Z1Y4 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trip6Q9Z1Y4 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trip6Q9Z1Y4 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trip6Q9Z1Y4 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trip6Q9Z1Y4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trip6Q9Z1Y4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trip6Q9Z1Y4 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trip6Q9Z1Y4 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trip6Q9Z1Y4 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Trip6Q9Z1Y4 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Trip6Q9Z1Y4 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Trip6Q9Z1Y4 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trip6Q9Z1Y4 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Trip6Q9Z1Y4 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trip6Q9Z1Y4 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trip6Q9Z1Y4 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trip6Q9Z1Y4 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trip6Q9Z1Y4 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms