Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ilf3Q9Z1X4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ilf3Q9Z1X4 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ilf3Q9Z1X4 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ilf3Q9Z1X4 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ilf3Q9Z1X4 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ilf3Q9Z1X4 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ilf3Q9Z1X4 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ilf3Q9Z1X4 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ilf3Q9Z1X4 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ilf3Q9Z1X4 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ilf3Q9Z1X4 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ilf3Q9Z1X4 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ilf3Q9Z1X4 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ilf3Q9Z1X4 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ilf3Q9Z1X4 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ilf3Q9Z1X4 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ilf3Q9Z1X4 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ilf3Q9Z1X4 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ilf3Q9Z1X4 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ilf3Q9Z1X4 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ilf3Q9Z1X4 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ilf3Q9Z1X4 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ilf3Q9Z1X4 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ilf3Q9Z1X4 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ilf3Q9Z1X4 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ilf3Q9Z1X4 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ilf3Q9Z1X4 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ilf3Q9Z1X4 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ilf3Q9Z1X4 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ilf3Q9Z1X4 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ilf3Q9Z1X4 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ilf3Q9Z1X4 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ilf3Q9Z1X4 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ilf3Q9Z1X4 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ilf3Q9Z1X4 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ilf3Q9Z1X4 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ilf3Q9Z1X4 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ilf3Q9Z1X4 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ilf3Q9Z1X4 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ilf3Q9Z1X4 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ilf3Q9Z1X4 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ilf3Q9Z1X4 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ilf3Q9Z1X4 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ilf3Q9Z1X4 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ilf3Q9Z1X4 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ilf3Q9Z1X4 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ilf3Q9Z1X4 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ilf3Q9Z1X4 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ilf3Q9Z1X4 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ilf3Q9Z1X4 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ilf3Q9Z1X4 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ilf3Q9Z1X4 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ilf3Q9Z1X4 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ilf3Q9Z1X4 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ilf3Q9Z1X4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ilf3Q9Z1X4 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ilf3Q9Z1X4 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ilf3Q9Z1X4 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ilf3Q9Z1X4 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ilf3Q9Z1X4 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ilf3Q9Z1X4 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ilf3Q9Z1X4 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ilf3Q9Z1X4 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ilf3Q9Z1X4 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ilf3Q9Z1X4 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ilf3Q9Z1X4 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ilf3Q9Z1X4 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ilf3Q9Z1X4 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ilf3Q9Z1X4 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ilf3Q9Z1X4 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ilf3Q9Z1X4 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ilf3Q9Z1X4 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ilf3Q9Z1X4 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ilf3Q9Z1X4 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ilf3Q9Z1X4 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ilf3Q9Z1X4 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ilf3Q9Z1X4 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ilf3Q9Z1X4 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ilf3Q9Z1X4 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ilf3Q9Z1X4 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ilf3Q9Z1X4 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ilf3Q9Z1X4 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ilf3Q9Z1X4 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ilf3Q9Z1X4 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ilf3Q9Z1X4 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ilf3Q9Z1X4 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ilf3Q9Z1X4 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ilf3Q9Z1X4 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ilf3Q9Z1X4 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ilf3Q9Z1X4 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ilf3Q9Z1X4 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ilf3Q9Z1X4 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ilf3Q9Z1X4 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ilf3Q9Z1X4 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ilf3Q9Z1X4 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ilf3Q9Z1X4 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ilf3Q9Z1X4 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ilf3Q9Z1X4 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ilf3Q9Z1X4 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms