Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q9

Vars, Valine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VarsQ9Z1Q9 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VarsQ9Z1Q9 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
VarsQ9Z1Q9 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
VarsQ9Z1Q9 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VarsQ9Z1Q9 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VarsQ9Z1Q9 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VarsQ9Z1Q9 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VarsQ9Z1Q9 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VarsQ9Z1Q9 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VarsQ9Z1Q9 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VarsQ9Z1Q9 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VarsQ9Z1Q9 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VarsQ9Z1Q9 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VarsQ9Z1Q9 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VarsQ9Z1Q9 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VarsQ9Z1Q9 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
VarsQ9Z1Q9 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VarsQ9Z1Q9 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VarsQ9Z1Q9 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VarsQ9Z1Q9 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VarsQ9Z1Q9 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VarsQ9Z1Q9 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VarsQ9Z1Q9 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VarsQ9Z1Q9 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
VarsQ9Z1Q9 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VarsQ9Z1Q9 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VarsQ9Z1Q9 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VarsQ9Z1Q9 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VarsQ9Z1Q9 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VarsQ9Z1Q9 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VarsQ9Z1Q9 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VarsQ9Z1Q9 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VarsQ9Z1Q9 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VarsQ9Z1Q9 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VarsQ9Z1Q9 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VarsQ9Z1Q9 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VarsQ9Z1Q9 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VarsQ9Z1Q9 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VarsQ9Z1Q9 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VarsQ9Z1Q9 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VarsQ9Z1Q9 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VarsQ9Z1Q9 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VarsQ9Z1Q9 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VarsQ9Z1Q9 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms