Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z104

Hmg20b, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20bQ9Z104 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hmg20bQ9Z104 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hmg20bQ9Z104 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hmg20bQ9Z104 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hmg20bQ9Z104 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hmg20bQ9Z104 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hmg20bQ9Z104 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hmg20bQ9Z104 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hmg20bQ9Z104 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hmg20bQ9Z104 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hmg20bQ9Z104 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hmg20bQ9Z104 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hmg20bQ9Z104 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hmg20bQ9Z104 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hmg20bQ9Z104 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hmg20bQ9Z104 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hmg20bQ9Z104 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hmg20bQ9Z104 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hmg20bQ9Z104 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hmg20bQ9Z104 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hmg20bQ9Z104 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hmg20bQ9Z104 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hmg20bQ9Z104 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hmg20bQ9Z104 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hmg20bQ9Z104 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hmg20bQ9Z104 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hmg20bQ9Z104 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hmg20bQ9Z104 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hmg20bQ9Z104 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hmg20bQ9Z104 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hmg20bQ9Z104 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hmg20bQ9Z104 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hmg20bQ9Z104 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Hmg20bQ9Z104 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hmg20bQ9Z104 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hmg20bQ9Z104 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hmg20bQ9Z104 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hmg20bQ9Z104 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hmg20bQ9Z104 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hmg20bQ9Z104 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hmg20bQ9Z104 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hmg20bQ9Z104 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Hmg20bQ9Z104 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hmg20bQ9Z104 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hmg20bQ9Z104 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hmg20bQ9Z104 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hmg20bQ9Z104 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hmg20bQ9Z104 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hmg20bQ9Z104 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hmg20bQ9Z104 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hmg20bQ9Z104 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hmg20bQ9Z104 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hmg20bQ9Z104 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hmg20bQ9Z104 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hmg20bQ9Z104 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hmg20bQ9Z104 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hmg20bQ9Z104 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hmg20bQ9Z104 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Hmg20bQ9Z104 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hmg20bQ9Z104 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hmg20bQ9Z104 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hmg20bQ9Z104 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hmg20bQ9Z104 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hmg20bQ9Z104 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hmg20bQ9Z104 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hmg20bQ9Z104 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hmg20bQ9Z104 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hmg20bQ9Z104 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Hmg20bQ9Z104 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hmg20bQ9Z104 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hmg20bQ9Z104 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Hmg20bQ9Z104 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hmg20bQ9Z104 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Hmg20bQ9Z104 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hmg20bQ9Z104 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Hmg20bQ9Z104 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hmg20bQ9Z104 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hmg20bQ9Z104 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hmg20bQ9Z104 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hmg20bQ9Z104 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hmg20bQ9Z104 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hmg20bQ9Z104 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hmg20bQ9Z104 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Hmg20bQ9Z104 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hmg20bQ9Z104 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hmg20bQ9Z104 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hmg20bQ9Z104 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hmg20bQ9Z104 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hmg20bQ9Z104 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hmg20bQ9Z104 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hmg20bQ9Z104 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hmg20bQ9Z104 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hmg20bQ9Z104 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hmg20bQ9Z104 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hmg20bQ9Z104 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hmg20bQ9Z104 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hmg20bQ9Z104 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hmg20bQ9Z104 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hmg20bQ9Z104 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hmg20bQ9Z104 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms