Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Z3

Skp2, S-phase kinase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp2Q9Z0Z3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Skp2Q9Z0Z3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Skp2Q9Z0Z3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms