Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W3

Nup160, Nuclear pore complex protein Nup160, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup160Q9Z0W3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Nup160Q9Z0W3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Nup160Q9Z0W3 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Nup160Q9Z0W3 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Nup160Q9Z0W3 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Nup160Q9Z0W3 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Nup160Q9Z0W3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Nup160Q9Z0W3 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nup160Q9Z0W3 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nup160Q9Z0W3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nup160Q9Z0W3 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nup160Q9Z0W3 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nup160Q9Z0W3 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Nup160Q9Z0W3 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nup160Q9Z0W3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nup160Q9Z0W3 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nup160Q9Z0W3 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Nup160Q9Z0W3 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Nup160Q9Z0W3 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nup160Q9Z0W3 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Nup160Q9Z0W3 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nup160Q9Z0W3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nup160Q9Z0W3 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nup160Q9Z0W3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nup160Q9Z0W3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nup160Q9Z0W3 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nup160Q9Z0W3 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nup160Q9Z0W3 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nup160Q9Z0W3 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Nup160Q9Z0W3 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nup160Q9Z0W3 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nup160Q9Z0W3 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nup160Q9Z0W3 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nup160Q9Z0W3 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nup160Q9Z0W3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nup160Q9Z0W3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nup160Q9Z0W3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nup160Q9Z0W3 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Nup160Q9Z0W3 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Nup160Q9Z0W3 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Nup160Q9Z0W3 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Nup160Q9Z0W3 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Nup160Q9Z0W3 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Nup160Q9Z0W3 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Nup160Q9Z0W3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Nup160Q9Z0W3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Nup160Q9Z0W3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Nup160Q9Z0W3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nup160Q9Z0W3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Nup160Q9Z0W3 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nup160Q9Z0W3 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Nup160Q9Z0W3 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nup160Q9Z0W3 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Nup160Q9Z0W3 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nup160Q9Z0W3 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nup160Q9Z0W3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nup160Q9Z0W3 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nup160Q9Z0W3 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nup160Q9Z0W3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nup160Q9Z0W3 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nup160Q9Z0W3 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nup160Q9Z0W3 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nup160Q9Z0W3 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nup160Q9Z0W3 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nup160Q9Z0W3 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nup160Q9Z0W3 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nup160Q9Z0W3 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nup160Q9Z0W3 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nup160Q9Z0W3 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nup160Q9Z0W3 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nup160Q9Z0W3 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nup160Q9Z0W3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nup160Q9Z0W3 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nup160Q9Z0W3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nup160Q9Z0W3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nup160Q9Z0W3 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nup160Q9Z0W3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nup160Q9Z0W3 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Nup160Q9Z0W3 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nup160Q9Z0W3 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nup160Q9Z0W3 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nup160Q9Z0W3 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nup160Q9Z0W3 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nup160Q9Z0W3 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nup160Q9Z0W3 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nup160Q9Z0W3 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nup160Q9Z0W3 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nup160Q9Z0W3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nup160Q9Z0W3 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nup160Q9Z0W3 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Nup160Q9Z0W3 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nup160Q9Z0W3 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nup160Q9Z0W3 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nup160Q9Z0W3 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nup160Q9Z0W3 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nup160Q9Z0W3 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Nup160Q9Z0W3 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nup160Q9Z0W3 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nup160Q9Z0W3 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nup160Q9Z0W3 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms