Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0U0

Xpr1, Xenotropic and polytropic retrovirus receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xpr1Q9Z0U0 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xpr1Q9Z0U0 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xpr1Q9Z0U0 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xpr1Q9Z0U0 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xpr1Q9Z0U0 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xpr1Q9Z0U0 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xpr1Q9Z0U0 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xpr1Q9Z0U0 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xpr1Q9Z0U0 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xpr1Q9Z0U0 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xpr1Q9Z0U0 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Xpr1Q9Z0U0 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Xpr1Q9Z0U0 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xpr1Q9Z0U0 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xpr1Q9Z0U0 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xpr1Q9Z0U0 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xpr1Q9Z0U0 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xpr1Q9Z0U0 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xpr1Q9Z0U0 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xpr1Q9Z0U0 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xpr1Q9Z0U0 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xpr1Q9Z0U0 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Xpr1Q9Z0U0 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xpr1Q9Z0U0 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xpr1Q9Z0U0 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xpr1Q9Z0U0 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xpr1Q9Z0U0 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xpr1Q9Z0U0 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xpr1Q9Z0U0 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xpr1Q9Z0U0 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xpr1Q9Z0U0 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xpr1Q9Z0U0 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xpr1Q9Z0U0 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xpr1Q9Z0U0 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xpr1Q9Z0U0 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xpr1Q9Z0U0 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xpr1Q9Z0U0 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xpr1Q9Z0U0 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xpr1Q9Z0U0 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xpr1Q9Z0U0 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xpr1Q9Z0U0 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xpr1Q9Z0U0 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Xpr1Q9Z0U0 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xpr1Q9Z0U0 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xpr1Q9Z0U0 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xpr1Q9Z0U0 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xpr1Q9Z0U0 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xpr1Q9Z0U0 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xpr1Q9Z0U0 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xpr1Q9Z0U0 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xpr1Q9Z0U0 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xpr1Q9Z0U0 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xpr1Q9Z0U0 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xpr1Q9Z0U0 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xpr1Q9Z0U0 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xpr1Q9Z0U0 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xpr1Q9Z0U0 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Xpr1Q9Z0U0 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xpr1Q9Z0U0 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Xpr1Q9Z0U0 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Xpr1Q9Z0U0 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xpr1Q9Z0U0 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xpr1Q9Z0U0 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xpr1Q9Z0U0 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xpr1Q9Z0U0 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xpr1Q9Z0U0 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xpr1Q9Z0U0 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xpr1Q9Z0U0 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Xpr1Q9Z0U0 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Xpr1Q9Z0U0 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Xpr1Q9Z0U0 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Xpr1Q9Z0U0 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Xpr1Q9Z0U0 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Xpr1Q9Z0U0 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Xpr1Q9Z0U0 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Xpr1Q9Z0U0 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Xpr1Q9Z0U0 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Xpr1Q9Z0U0 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Xpr1Q9Z0U0 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Xpr1Q9Z0U0 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Xpr1Q9Z0U0 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Xpr1Q9Z0U0 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Xpr1Q9Z0U0 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Xpr1Q9Z0U0 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Xpr1Q9Z0U0 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Xpr1Q9Z0U0 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Xpr1Q9Z0U0 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Xpr1Q9Z0U0 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Xpr1Q9Z0U0 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Xpr1Q9Z0U0 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Xpr1Q9Z0U0 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xpr1Q9Z0U0 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xpr1Q9Z0U0 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xpr1Q9Z0U0 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xpr1Q9Z0U0 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xpr1Q9Z0U0 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xpr1Q9Z0U0 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xpr1Q9Z0U0 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xpr1Q9Z0U0 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Xpr1Q9Z0U0 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms