Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0T9

Itgb6, Integrin beta-6, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb6Q9Z0T9 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itgb6Q9Z0T9 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itgb6Q9Z0T9 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itgb6Q9Z0T9 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itgb6Q9Z0T9 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itgb6Q9Z0T9 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Itgb6Q9Z0T9 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itgb6Q9Z0T9 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itgb6Q9Z0T9 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itgb6Q9Z0T9 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itgb6Q9Z0T9 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itgb6Q9Z0T9 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itgb6Q9Z0T9 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itgb6Q9Z0T9 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itgb6Q9Z0T9 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itgb6Q9Z0T9 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itgb6Q9Z0T9 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itgb6Q9Z0T9 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itgb6Q9Z0T9 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itgb6Q9Z0T9 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itgb6Q9Z0T9 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itgb6Q9Z0T9 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itgb6Q9Z0T9 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itgb6Q9Z0T9 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itgb6Q9Z0T9 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itgb6Q9Z0T9 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itgb6Q9Z0T9 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itgb6Q9Z0T9 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itgb6Q9Z0T9 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itgb6Q9Z0T9 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itgb6Q9Z0T9 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itgb6Q9Z0T9 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itgb6Q9Z0T9 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itgb6Q9Z0T9 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itgb6Q9Z0T9 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itgb6Q9Z0T9 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itgb6Q9Z0T9 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itgb6Q9Z0T9 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itgb6Q9Z0T9 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itgb6Q9Z0T9 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itgb6Q9Z0T9 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itgb6Q9Z0T9 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itgb6Q9Z0T9 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itgb6Q9Z0T9 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itgb6Q9Z0T9 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Itgb6Q9Z0T9 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Itgb6Q9Z0T9 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Itgb6Q9Z0T9 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb6Q9Z0T9 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb6Q9Z0T9 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb6Q9Z0T9 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb6Q9Z0T9 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb6Q9Z0T9 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb6Q9Z0T9 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb6Q9Z0T9 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb6Q9Z0T9 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb6Q9Z0T9 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb6Q9Z0T9 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb6Q9Z0T9 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb6Q9Z0T9 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb6Q9Z0T9 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb6Q9Z0T9 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb6Q9Z0T9 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb6Q9Z0T9 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb6Q9Z0T9 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb6Q9Z0T9 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb6Q9Z0T9 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb6Q9Z0T9 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb6Q9Z0T9 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb6Q9Z0T9 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb6Q9Z0T9 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb6Q9Z0T9 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb6Q9Z0T9 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb6Q9Z0T9 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb6Q9Z0T9 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb6Q9Z0T9 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb6Q9Z0T9 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb6Q9Z0T9 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb6Q9Z0T9 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb6Q9Z0T9 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb6Q9Z0T9 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb6Q9Z0T9 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb6Q9Z0T9 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb6Q9Z0T9 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb6Q9Z0T9 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb6Q9Z0T9 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb6Q9Z0T9 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb6Q9Z0T9 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb6Q9Z0T9 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb6Q9Z0T9 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb6Q9Z0T9 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb6Q9Z0T9 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb6Q9Z0T9 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb6Q9Z0T9 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb6Q9Z0T9 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb6Q9Z0T9 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb6Q9Z0T9 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb6Q9Z0T9 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb6Q9Z0T9 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb6Q9Z0T9 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms