Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVQ0

Pmfbp1, Polyamine-modulated factor 1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pmfbp1Q9WVQ0 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Pmfbp1Q9WVQ0 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pmfbp1Q9WVQ0 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pmfbp1Q9WVQ0 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pmfbp1Q9WVQ0 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pmfbp1Q9WVQ0 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pmfbp1Q9WVQ0 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Pmfbp1Q9WVQ0 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pmfbp1Q9WVQ0 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pmfbp1Q9WVQ0 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pmfbp1Q9WVQ0 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pmfbp1Q9WVQ0 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pmfbp1Q9WVQ0 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pmfbp1Q9WVQ0 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pmfbp1Q9WVQ0 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pmfbp1Q9WVQ0 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pmfbp1Q9WVQ0 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pmfbp1Q9WVQ0 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pmfbp1Q9WVQ0 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Pmfbp1Q9WVQ0 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pmfbp1Q9WVQ0 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pmfbp1Q9WVQ0 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pmfbp1Q9WVQ0 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pmfbp1Q9WVQ0 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pmfbp1Q9WVQ0 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Pmfbp1Q9WVQ0 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Pmfbp1Q9WVQ0 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Pmfbp1Q9WVQ0 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Pmfbp1Q9WVQ0 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Pmfbp1Q9WVQ0 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pmfbp1Q9WVQ0 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pmfbp1Q9WVQ0 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pmfbp1Q9WVQ0 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pmfbp1Q9WVQ0 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pmfbp1Q9WVQ0 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pmfbp1Q9WVQ0 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pmfbp1Q9WVQ0 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pmfbp1Q9WVQ0 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pmfbp1Q9WVQ0 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pmfbp1Q9WVQ0 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pmfbp1Q9WVQ0 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pmfbp1Q9WVQ0 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pmfbp1Q9WVQ0 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pmfbp1Q9WVQ0 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pmfbp1Q9WVQ0 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pmfbp1Q9WVQ0 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pmfbp1Q9WVQ0 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pmfbp1Q9WVQ0 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pmfbp1Q9WVQ0 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pmfbp1Q9WVQ0 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pmfbp1Q9WVQ0 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pmfbp1Q9WVQ0 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pmfbp1Q9WVQ0 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pmfbp1Q9WVQ0 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pmfbp1Q9WVQ0 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pmfbp1Q9WVQ0 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pmfbp1Q9WVQ0 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Pmfbp1Q9WVQ0 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pmfbp1Q9WVQ0 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pmfbp1Q9WVQ0 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pmfbp1Q9WVQ0 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pmfbp1Q9WVQ0 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pmfbp1Q9WVQ0 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pmfbp1Q9WVQ0 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pmfbp1Q9WVQ0 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pmfbp1Q9WVQ0 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pmfbp1Q9WVQ0 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pmfbp1Q9WVQ0 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pmfbp1Q9WVQ0 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pmfbp1Q9WVQ0 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pmfbp1Q9WVQ0 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pmfbp1Q9WVQ0 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pmfbp1Q9WVQ0 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pmfbp1Q9WVQ0 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pmfbp1Q9WVQ0 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pmfbp1Q9WVQ0 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pmfbp1Q9WVQ0 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pmfbp1Q9WVQ0 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pmfbp1Q9WVQ0 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pmfbp1Q9WVQ0 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pmfbp1Q9WVQ0 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pmfbp1Q9WVQ0 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pmfbp1Q9WVQ0 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pmfbp1Q9WVQ0 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Pmfbp1Q9WVQ0 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pmfbp1Q9WVQ0 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pmfbp1Q9WVQ0 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pmfbp1Q9WVQ0 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Pmfbp1Q9WVQ0 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pmfbp1Q9WVQ0 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pmfbp1Q9WVQ0 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pmfbp1Q9WVQ0 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pmfbp1Q9WVQ0 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms