Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVF7

Pole, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 2,283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PoleQ9WVF7 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PoleQ9WVF7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PoleQ9WVF7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PoleQ9WVF7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PoleQ9WVF7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PoleQ9WVF7 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PoleQ9WVF7 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PoleQ9WVF7 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PoleQ9WVF7 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PoleQ9WVF7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PoleQ9WVF7 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PoleQ9WVF7 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PoleQ9WVF7 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PoleQ9WVF7 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PoleQ9WVF7 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PoleQ9WVF7 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PoleQ9WVF7 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PoleQ9WVF7 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PoleQ9WVF7 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PoleQ9WVF7 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PoleQ9WVF7 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PoleQ9WVF7 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PoleQ9WVF7 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PoleQ9WVF7 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PoleQ9WVF7 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PoleQ9WVF7 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PoleQ9WVF7 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PoleQ9WVF7 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PoleQ9WVF7 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PoleQ9WVF7 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PoleQ9WVF7 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PoleQ9WVF7 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PoleQ9WVF7 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PoleQ9WVF7 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PoleQ9WVF7 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PoleQ9WVF7 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PoleQ9WVF7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PoleQ9WVF7 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PoleQ9WVF7 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PoleQ9WVF7 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PoleQ9WVF7 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PoleQ9WVF7 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PoleQ9WVF7 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PoleQ9WVF7 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PoleQ9WVF7 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PoleQ9WVF7 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PoleQ9WVF7 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PoleQ9WVF7 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PoleQ9WVF7 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PoleQ9WVF7 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PoleQ9WVF7 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PoleQ9WVF7 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PoleQ9WVF7 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PoleQ9WVF7 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PoleQ9WVF7 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PoleQ9WVF7 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PoleQ9WVF7 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PoleQ9WVF7 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PoleQ9WVF7 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PoleQ9WVF7 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PoleQ9WVF7 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PoleQ9WVF7 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PoleQ9WVF7 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PoleQ9WVF7 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PoleQ9WVF7 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PoleQ9WVF7 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PoleQ9WVF7 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PoleQ9WVF7 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PoleQ9WVF7 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PoleQ9WVF7 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PoleQ9WVF7 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PoleQ9WVF7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PoleQ9WVF7 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PoleQ9WVF7 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PoleQ9WVF7 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PoleQ9WVF7 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PoleQ9WVF7 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PoleQ9WVF7 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PoleQ9WVF7 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PoleQ9WVF7 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PoleQ9WVF7 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PoleQ9WVF7 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PoleQ9WVF7 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PoleQ9WVF7 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PoleQ9WVF7 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PoleQ9WVF7 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PoleQ9WVF7 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PoleQ9WVF7 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PoleQ9WVF7 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PoleQ9WVF7 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PoleQ9WVF7 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PoleQ9WVF7 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PoleQ9WVF7 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PoleQ9WVF7 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PoleQ9WVF7 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PoleQ9WVF7 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PoleQ9WVF7 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PoleQ9WVF7 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PoleQ9WVF7 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PoleQ9WVF7 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms