Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVD4

Clcn5, H(+)/Cl(-) exchange transporter 5, mousemouse

Predictions only

Length 746 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn5Q9WVD4 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clcn5Q9WVD4 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clcn5Q9WVD4 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clcn5Q9WVD4 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clcn5Q9WVD4 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clcn5Q9WVD4 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clcn5Q9WVD4 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Clcn5Q9WVD4 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clcn5Q9WVD4 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clcn5Q9WVD4 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clcn5Q9WVD4 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clcn5Q9WVD4 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Clcn5Q9WVD4 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clcn5Q9WVD4 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clcn5Q9WVD4 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clcn5Q9WVD4 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Clcn5Q9WVD4 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clcn5Q9WVD4 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clcn5Q9WVD4 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clcn5Q9WVD4 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clcn5Q9WVD4 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clcn5Q9WVD4 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clcn5Q9WVD4 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clcn5Q9WVD4 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clcn5Q9WVD4 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Clcn5Q9WVD4 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Clcn5Q9WVD4 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Clcn5Q9WVD4 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Clcn5Q9WVD4 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Clcn5Q9WVD4 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clcn5Q9WVD4 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clcn5Q9WVD4 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clcn5Q9WVD4 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clcn5Q9WVD4 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clcn5Q9WVD4 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clcn5Q9WVD4 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clcn5Q9WVD4 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clcn5Q9WVD4 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clcn5Q9WVD4 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clcn5Q9WVD4 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clcn5Q9WVD4 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clcn5Q9WVD4 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clcn5Q9WVD4 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clcn5Q9WVD4 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clcn5Q9WVD4 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clcn5Q9WVD4 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clcn5Q9WVD4 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clcn5Q9WVD4 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clcn5Q9WVD4 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clcn5Q9WVD4 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clcn5Q9WVD4 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Clcn5Q9WVD4 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clcn5Q9WVD4 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clcn5Q9WVD4 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clcn5Q9WVD4 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clcn5Q9WVD4 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clcn5Q9WVD4 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clcn5Q9WVD4 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clcn5Q9WVD4 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clcn5Q9WVD4 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clcn5Q9WVD4 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clcn5Q9WVD4 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clcn5Q9WVD4 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clcn5Q9WVD4 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clcn5Q9WVD4 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clcn5Q9WVD4 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clcn5Q9WVD4 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clcn5Q9WVD4 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clcn5Q9WVD4 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clcn5Q9WVD4 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clcn5Q9WVD4 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clcn5Q9WVD4 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clcn5Q9WVD4 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Clcn5Q9WVD4 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clcn5Q9WVD4 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clcn5Q9WVD4 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Clcn5Q9WVD4 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clcn5Q9WVD4 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clcn5Q9WVD4 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clcn5Q9WVD4 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clcn5Q9WVD4 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clcn5Q9WVD4 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clcn5Q9WVD4 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clcn5Q9WVD4 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clcn5Q9WVD4 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Clcn5Q9WVD4 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clcn5Q9WVD4 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clcn5Q9WVD4 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clcn5Q9WVD4 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clcn5Q9WVD4 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clcn5Q9WVD4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clcn5Q9WVD4 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clcn5Q9WVD4 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clcn5Q9WVD4 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clcn5Q9WVD4 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Clcn5Q9WVD4 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Clcn5Q9WVD4 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Clcn5Q9WVD4 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Clcn5Q9WVD4 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Clcn5Q9WVD4 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms