Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUD1

Stub1, STIP1 homology and U box-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stub1Q9WUD1 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Stub1Q9WUD1 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms