Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTV6

Usp18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp18Q9WTV6 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp18Q9WTV6 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp18Q9WTV6 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp18Q9WTV6 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp18Q9WTV6 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp18Q9WTV6 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp18Q9WTV6 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp18Q9WTV6 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp18Q9WTV6 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp18Q9WTV6 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp18Q9WTV6 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp18Q9WTV6 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp18Q9WTV6 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp18Q9WTV6 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp18Q9WTV6 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp18Q9WTV6 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp18Q9WTV6 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp18Q9WTV6 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp18Q9WTV6 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp18Q9WTV6 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp18Q9WTV6 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp18Q9WTV6 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp18Q9WTV6 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp18Q9WTV6 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp18Q9WTV6 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp18Q9WTV6 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp18Q9WTV6 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp18Q9WTV6 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp18Q9WTV6 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp18Q9WTV6 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp18Q9WTV6 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp18Q9WTV6 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp18Q9WTV6 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp18Q9WTV6 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp18Q9WTV6 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp18Q9WTV6 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp18Q9WTV6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp18Q9WTV6 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp18Q9WTV6 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp18Q9WTV6 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp18Q9WTV6 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
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Usp18Q9WTV6 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp18Q9WTV6 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp18Q9WTV6 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp18Q9WTV6 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp18Q9WTV6 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp18Q9WTV6 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp18Q9WTV6 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp18Q9WTV6 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp18Q9WTV6 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp18Q9WTV6 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp18Q9WTV6 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp18Q9WTV6 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp18Q9WTV6 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp18Q9WTV6 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp18Q9WTV6 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp18Q9WTV6 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp18Q9WTV6 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp18Q9WTV6 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp18Q9WTV6 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp18Q9WTV6 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp18Q9WTV6 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp18Q9WTV6 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp18Q9WTV6 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp18Q9WTV6 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Usp18Q9WTV6 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Usp18Q9WTV6 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp18Q9WTV6 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp18Q9WTV6 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp18Q9WTV6 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp18Q9WTV6 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp18Q9WTV6 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp18Q9WTV6 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp18Q9WTV6 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp18Q9WTV6 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp18Q9WTV6 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp18Q9WTV6 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp18Q9WTV6 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp18Q9WTV6 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp18Q9WTV6 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp18Q9WTV6 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp18Q9WTV6 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp18Q9WTV6 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp18Q9WTV6 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp18Q9WTV6 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp18Q9WTV6 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp18Q9WTV6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp18Q9WTV6 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp18Q9WTV6 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp18Q9WTV6 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp18Q9WTV6 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp18Q9WTV6 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp18Q9WTV6 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp18Q9WTV6 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp18Q9WTV6 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp18Q9WTV6 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp18Q9WTV6 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp18Q9WTV6 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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