Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTK8

Spo11, Meiotic recombination protein SPO11, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spo11Q9WTK8 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spo11Q9WTK8 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spo11Q9WTK8 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spo11Q9WTK8 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spo11Q9WTK8 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spo11Q9WTK8 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spo11Q9WTK8 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spo11Q9WTK8 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spo11Q9WTK8 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spo11Q9WTK8 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spo11Q9WTK8 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spo11Q9WTK8 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spo11Q9WTK8 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spo11Q9WTK8 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spo11Q9WTK8 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spo11Q9WTK8 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spo11Q9WTK8 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spo11Q9WTK8 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spo11Q9WTK8 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spo11Q9WTK8 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spo11Q9WTK8 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spo11Q9WTK8 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spo11Q9WTK8 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spo11Q9WTK8 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spo11Q9WTK8 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spo11Q9WTK8 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spo11Q9WTK8 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spo11Q9WTK8 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spo11Q9WTK8 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spo11Q9WTK8 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spo11Q9WTK8 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spo11Q9WTK8 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spo11Q9WTK8 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spo11Q9WTK8 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spo11Q9WTK8 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spo11Q9WTK8 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spo11Q9WTK8 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spo11Q9WTK8 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spo11Q9WTK8 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spo11Q9WTK8 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spo11Q9WTK8 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Spo11Q9WTK8 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Spo11Q9WTK8 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spo11Q9WTK8 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spo11Q9WTK8 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spo11Q9WTK8 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spo11Q9WTK8 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spo11Q9WTK8 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spo11Q9WTK8 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spo11Q9WTK8 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spo11Q9WTK8 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spo11Q9WTK8 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spo11Q9WTK8 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spo11Q9WTK8 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spo11Q9WTK8 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spo11Q9WTK8 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spo11Q9WTK8 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spo11Q9WTK8 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spo11Q9WTK8 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spo11Q9WTK8 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spo11Q9WTK8 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spo11Q9WTK8 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spo11Q9WTK8 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spo11Q9WTK8 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spo11Q9WTK8 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spo11Q9WTK8 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spo11Q9WTK8 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spo11Q9WTK8 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spo11Q9WTK8 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spo11Q9WTK8 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spo11Q9WTK8 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Spo11Q9WTK8 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spo11Q9WTK8 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spo11Q9WTK8 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spo11Q9WTK8 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Spo11Q9WTK8 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spo11Q9WTK8 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spo11Q9WTK8 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spo11Q9WTK8 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spo11Q9WTK8 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spo11Q9WTK8 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Spo11Q9WTK8 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spo11Q9WTK8 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Spo11Q9WTK8 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spo11Q9WTK8 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spo11Q9WTK8 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spo11Q9WTK8 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spo11Q9WTK8 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spo11Q9WTK8 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spo11Q9WTK8 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spo11Q9WTK8 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spo11Q9WTK8 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spo11Q9WTK8 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spo11Q9WTK8 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spo11Q9WTK8 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spo11Q9WTK8 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spo11Q9WTK8 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spo11Q9WTK8 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spo11Q9WTK8 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spo11Q9WTK8 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms