Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Trpc2Q9R244 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trpc2Q9R244 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Trpc2Q9R244 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trpc2Q9R244 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trpc2Q9R244 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trpc2Q9R244 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trpc2Q9R244 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trpc2Q9R244 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trpc2Q9R244 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trpc2Q9R244 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trpc2Q9R244 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trpc2Q9R244 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trpc2Q9R244 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trpc2Q9R244 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Trpc2Q9R244 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Trpc2Q9R244 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Trpc2Q9R244 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trpc2Q9R244 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trpc2Q9R244 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trpc2Q9R244 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trpc2Q9R244 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trpc2Q9R244 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trpc2Q9R244 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trpc2Q9R244 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trpc2Q9R244 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trpc2Q9R244 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trpc2Q9R244 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trpc2Q9R244 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trpc2Q9R244 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trpc2Q9R244 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trpc2Q9R244 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trpc2Q9R244 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trpc2Q9R244 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trpc2Q9R244 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trpc2Q9R244 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trpc2Q9R244 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trpc2Q9R244 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trpc2Q9R244 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trpc2Q9R244 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trpc2Q9R244 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trpc2Q9R244 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trpc2Q9R244 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trpc2Q9R244 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trpc2Q9R244 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trpc2Q9R244 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trpc2Q9R244 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trpc2Q9R244 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trpc2Q9R244 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trpc2Q9R244 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trpc2Q9R244 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trpc2Q9R244 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trpc2Q9R244 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trpc2Q9R244 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trpc2Q9R244 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trpc2Q9R244 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trpc2Q9R244 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trpc2Q9R244 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trpc2Q9R244 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trpc2Q9R244 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trpc2Q9R244 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trpc2Q9R244 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trpc2Q9R244 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trpc2Q9R244 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trpc2Q9R244 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trpc2Q9R244 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trpc2Q9R244 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Trpc2Q9R244 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trpc2Q9R244 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Trpc2Q9R244 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trpc2Q9R244 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trpc2Q9R244 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trpc2Q9R244 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trpc2Q9R244 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trpc2Q9R244 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trpc2Q9R244 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trpc2Q9R244 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trpc2Q9R244 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trpc2Q9R244 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trpc2Q9R244 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trpc2Q9R244 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trpc2Q9R244 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trpc2Q9R244 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trpc2Q9R244 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trpc2Q9R244 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trpc2Q9R244 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Trpc2Q9R244 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trpc2Q9R244 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trpc2Q9R244 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trpc2Q9R244 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trpc2Q9R244 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trpc2Q9R244 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trpc2Q9R244 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trpc2Q9R244 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trpc2Q9R244 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trpc2Q9R244 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trpc2Q9R244 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trpc2Q9R244 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Trpc2Q9R244 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trpc2Q9R244 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms