Protein–RNA interactions for Protein: Q9R155

Slc26a4, Pendrin, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc26a4Q9R155 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Slc26a4Q9R155 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Slc26a4Q9R155 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Slc26a4Q9R155 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Slc26a4Q9R155 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Slc26a4Q9R155 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Slc26a4Q9R155 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Slc26a4Q9R155 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slc26a4Q9R155 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Slc26a4Q9R155 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slc26a4Q9R155 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slc26a4Q9R155 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slc26a4Q9R155 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slc26a4Q9R155 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slc26a4Q9R155 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slc26a4Q9R155 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slc26a4Q9R155 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slc26a4Q9R155 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slc26a4Q9R155 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slc26a4Q9R155 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slc26a4Q9R155 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc26a4Q9R155 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc26a4Q9R155 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc26a4Q9R155 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc26a4Q9R155 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc26a4Q9R155 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc26a4Q9R155 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc26a4Q9R155 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc26a4Q9R155 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc26a4Q9R155 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc26a4Q9R155 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc26a4Q9R155 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc26a4Q9R155 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc26a4Q9R155 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc26a4Q9R155 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc26a4Q9R155 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc26a4Q9R155 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc26a4Q9R155 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc26a4Q9R155 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc26a4Q9R155 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc26a4Q9R155 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc26a4Q9R155 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc26a4Q9R155 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc26a4Q9R155 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc26a4Q9R155 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc26a4Q9R155 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc26a4Q9R155 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc26a4Q9R155 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc26a4Q9R155 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc26a4Q9R155 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc26a4Q9R155 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc26a4Q9R155 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc26a4Q9R155 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc26a4Q9R155 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc26a4Q9R155 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc26a4Q9R155 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc26a4Q9R155 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc26a4Q9R155 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc26a4Q9R155 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc26a4Q9R155 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc26a4Q9R155 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc26a4Q9R155 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc26a4Q9R155 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc26a4Q9R155 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc26a4Q9R155 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc26a4Q9R155 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc26a4Q9R155 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc26a4Q9R155 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc26a4Q9R155 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc26a4Q9R155 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc26a4Q9R155 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc26a4Q9R155 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc26a4Q9R155 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc26a4Q9R155 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc26a4Q9R155 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc26a4Q9R155 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc26a4Q9R155 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc26a4Q9R155 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc26a4Q9R155 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc26a4Q9R155 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc26a4Q9R155 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc26a4Q9R155 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc26a4Q9R155 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc26a4Q9R155 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc26a4Q9R155 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc26a4Q9R155 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc26a4Q9R155 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc26a4Q9R155 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc26a4Q9R155 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc26a4Q9R155 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc26a4Q9R155 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc26a4Q9R155 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc26a4Q9R155 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc26a4Q9R155 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc26a4Q9R155 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc26a4Q9R155 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc26a4Q9R155 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc26a4Q9R155 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc26a4Q9R155 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc26a4Q9R155 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms