Protein–RNA interactions for Protein: Q9R118

Htra1, Serine protease HTRA1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htra1Q9R118 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Htra1Q9R118 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Htra1Q9R118 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Htra1Q9R118 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Htra1Q9R118 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Htra1Q9R118 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Htra1Q9R118 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Htra1Q9R118 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Htra1Q9R118 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Htra1Q9R118 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Htra1Q9R118 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Htra1Q9R118 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Htra1Q9R118 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Htra1Q9R118 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Htra1Q9R118 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Htra1Q9R118 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Htra1Q9R118 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Htra1Q9R118 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Htra1Q9R118 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Htra1Q9R118 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Htra1Q9R118 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Htra1Q9R118 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Htra1Q9R118 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Htra1Q9R118 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Htra1Q9R118 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Htra1Q9R118 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Htra1Q9R118 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Htra1Q9R118 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Htra1Q9R118 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Htra1Q9R118 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Htra1Q9R118 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Htra1Q9R118 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Htra1Q9R118 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Htra1Q9R118 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Htra1Q9R118 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Htra1Q9R118 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Htra1Q9R118 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Htra1Q9R118 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Htra1Q9R118 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Htra1Q9R118 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Htra1Q9R118 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Htra1Q9R118 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms