Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B9

Plod2, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod2Q9R0B9 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Plod2Q9R0B9 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Plod2Q9R0B9 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Plod2Q9R0B9 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms