Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B7

Znf346, Zinc finger protein 346, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf346Q9R0B7 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Znf346Q9R0B7 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Znf346Q9R0B7 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Znf346Q9R0B7 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Znf346Q9R0B7 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Znf346Q9R0B7 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Znf346Q9R0B7 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Znf346Q9R0B7 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Znf346Q9R0B7 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Znf346Q9R0B7 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf346Q9R0B7 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf346Q9R0B7 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf346Q9R0B7 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf346Q9R0B7 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf346Q9R0B7 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf346Q9R0B7 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf346Q9R0B7 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf346Q9R0B7 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf346Q9R0B7 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf346Q9R0B7 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf346Q9R0B7 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf346Q9R0B7 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf346Q9R0B7 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf346Q9R0B7 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf346Q9R0B7 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf346Q9R0B7 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf346Q9R0B7 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf346Q9R0B7 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf346Q9R0B7 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf346Q9R0B7 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf346Q9R0B7 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf346Q9R0B7 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf346Q9R0B7 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf346Q9R0B7 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf346Q9R0B7 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf346Q9R0B7 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf346Q9R0B7 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf346Q9R0B7 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf346Q9R0B7 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf346Q9R0B7 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf346Q9R0B7 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf346Q9R0B7 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf346Q9R0B7 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf346Q9R0B7 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf346Q9R0B7 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf346Q9R0B7 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf346Q9R0B7 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf346Q9R0B7 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf346Q9R0B7 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf346Q9R0B7 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf346Q9R0B7 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf346Q9R0B7 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf346Q9R0B7 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf346Q9R0B7 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf346Q9R0B7 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf346Q9R0B7 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf346Q9R0B7 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf346Q9R0B7 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf346Q9R0B7 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf346Q9R0B7 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf346Q9R0B7 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Znf346Q9R0B7 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Znf346Q9R0B7 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Znf346Q9R0B7 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Znf346Q9R0B7 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Znf346Q9R0B7 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Znf346Q9R0B7 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf346Q9R0B7 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf346Q9R0B7 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf346Q9R0B7 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf346Q9R0B7 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf346Q9R0B7 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf346Q9R0B7 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf346Q9R0B7 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf346Q9R0B7 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf346Q9R0B7 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf346Q9R0B7 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf346Q9R0B7 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf346Q9R0B7 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf346Q9R0B7 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf346Q9R0B7 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf346Q9R0B7 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf346Q9R0B7 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf346Q9R0B7 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf346Q9R0B7 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf346Q9R0B7 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf346Q9R0B7 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf346Q9R0B7 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf346Q9R0B7 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf346Q9R0B7 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf346Q9R0B7 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf346Q9R0B7 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf346Q9R0B7 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf346Q9R0B7 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf346Q9R0B7 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf346Q9R0B7 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf346Q9R0B7 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf346Q9R0B7 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf346Q9R0B7 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf346Q9R0B7 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms