Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Lamc3Q9R0B6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Lamc3Q9R0B6 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Lamc3Q9R0B6 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Lamc3Q9R0B6 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Lamc3Q9R0B6 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Lamc3Q9R0B6 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Lamc3Q9R0B6 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Lamc3Q9R0B6 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Lamc3Q9R0B6 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Lamc3Q9R0B6 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Lamc3Q9R0B6 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Lamc3Q9R0B6 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Lamc3Q9R0B6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Lamc3Q9R0B6 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Lamc3Q9R0B6 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Lamc3Q9R0B6 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Lamc3Q9R0B6 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Lamc3Q9R0B6 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Lamc3Q9R0B6 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Lamc3Q9R0B6 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Lamc3Q9R0B6 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Lamc3Q9R0B6 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Lamc3Q9R0B6 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Lamc3Q9R0B6 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Lamc3Q9R0B6 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Lamc3Q9R0B6 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Lamc3Q9R0B6 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Lamc3Q9R0B6 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Lamc3Q9R0B6 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Lamc3Q9R0B6 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Lamc3Q9R0B6 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Lamc3Q9R0B6 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Lamc3Q9R0B6 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Lamc3Q9R0B6 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Lamc3Q9R0B6 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Lamc3Q9R0B6 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Lamc3Q9R0B6 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Lamc3Q9R0B6 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Lamc3Q9R0B6 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Lamc3Q9R0B6 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Lamc3Q9R0B6 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Lamc3Q9R0B6 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Lamc3Q9R0B6 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Lamc3Q9R0B6 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Lamc3Q9R0B6 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Lamc3Q9R0B6 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Lamc3Q9R0B6 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Lamc3Q9R0B6 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Lamc3Q9R0B6 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Lamc3Q9R0B6 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Lamc3Q9R0B6 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Lamc3Q9R0B6 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Lamc3Q9R0B6 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Lamc3Q9R0B6 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Lamc3Q9R0B6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Lamc3Q9R0B6 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Lamc3Q9R0B6 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Lamc3Q9R0B6 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Lamc3Q9R0B6 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Lamc3Q9R0B6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Lamc3Q9R0B6 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Lamc3Q9R0B6 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Lamc3Q9R0B6 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Lamc3Q9R0B6 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Lamc3Q9R0B6 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Lamc3Q9R0B6 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Lamc3Q9R0B6 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Lamc3Q9R0B6 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Lamc3Q9R0B6 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Lamc3Q9R0B6 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Lamc3Q9R0B6 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Lamc3Q9R0B6 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Lamc3Q9R0B6 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Lamc3Q9R0B6 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Lamc3Q9R0B6 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Lamc3Q9R0B6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Lamc3Q9R0B6 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Lamc3Q9R0B6 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Lamc3Q9R0B6 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Lamc3Q9R0B6 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Lamc3Q9R0B6 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Lamc3Q9R0B6 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Lamc3Q9R0B6 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Lamc3Q9R0B6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Lamc3Q9R0B6 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Lamc3Q9R0B6 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Lamc3Q9R0B6 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Lamc3Q9R0B6 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Lamc3Q9R0B6 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Lamc3Q9R0B6 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Lamc3Q9R0B6 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Lamc3Q9R0B6 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Lamc3Q9R0B6 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Lamc3Q9R0B6 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Lamc3Q9R0B6 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Lamc3Q9R0B6 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Lamc3Q9R0B6 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Lamc3Q9R0B6 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Lamc3Q9R0B6 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms