Protein–RNA interactions for Protein: Q9R061

Nubp2, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP2, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nubp2Q9R061 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nubp2Q9R061 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms