Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ercc4Q9QZD4 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ercc4Q9QZD4 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ercc4Q9QZD4 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Ercc4Q9QZD4 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ercc4Q9QZD4 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ercc4Q9QZD4 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ercc4Q9QZD4 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ercc4Q9QZD4 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ercc4Q9QZD4 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ercc4Q9QZD4 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ercc4Q9QZD4 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ercc4Q9QZD4 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ercc4Q9QZD4 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ercc4Q9QZD4 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ercc4Q9QZD4 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ercc4Q9QZD4 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ercc4Q9QZD4 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ercc4Q9QZD4 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ercc4Q9QZD4 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ercc4Q9QZD4 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ercc4Q9QZD4 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ercc4Q9QZD4 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ercc4Q9QZD4 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ercc4Q9QZD4 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ercc4Q9QZD4 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ercc4Q9QZD4 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ercc4Q9QZD4 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ercc4Q9QZD4 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ercc4Q9QZD4 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ercc4Q9QZD4 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ercc4Q9QZD4 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ercc4Q9QZD4 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ercc4Q9QZD4 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Ercc4Q9QZD4 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ercc4Q9QZD4 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ercc4Q9QZD4 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ercc4Q9QZD4 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ercc4Q9QZD4 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ercc4Q9QZD4 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ercc4Q9QZD4 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ercc4Q9QZD4 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ercc4Q9QZD4 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ercc4Q9QZD4 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ercc4Q9QZD4 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ercc4Q9QZD4 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ercc4Q9QZD4 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ercc4Q9QZD4 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ercc4Q9QZD4 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ercc4Q9QZD4 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ercc4Q9QZD4 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ercc4Q9QZD4 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ercc4Q9QZD4 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ercc4Q9QZD4 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ercc4Q9QZD4 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Ercc4Q9QZD4 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ercc4Q9QZD4 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ercc4Q9QZD4 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ercc4Q9QZD4 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ercc4Q9QZD4 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ercc4Q9QZD4 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ercc4Q9QZD4 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ercc4Q9QZD4 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ercc4Q9QZD4 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ercc4Q9QZD4 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ercc4Q9QZD4 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ercc4Q9QZD4 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ercc4Q9QZD4 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Ercc4Q9QZD4 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ercc4Q9QZD4 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ercc4Q9QZD4 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ercc4Q9QZD4 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ercc4Q9QZD4 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ercc4Q9QZD4 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ercc4Q9QZD4 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ercc4Q9QZD4 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Ercc4Q9QZD4 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ercc4Q9QZD4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ercc4Q9QZD4 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ercc4Q9QZD4 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Ercc4Q9QZD4 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ercc4Q9QZD4 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Ercc4Q9QZD4 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ercc4Q9QZD4 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ercc4Q9QZD4 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ercc4Q9QZD4 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ercc4Q9QZD4 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ercc4Q9QZD4 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ercc4Q9QZD4 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ercc4Q9QZD4 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ercc4Q9QZD4 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ercc4Q9QZD4 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ercc4Q9QZD4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ercc4Q9QZD4 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ercc4Q9QZD4 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Ercc4Q9QZD4 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ercc4Q9QZD4 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ercc4Q9QZD4 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ercc4Q9QZD4 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ercc4Q9QZD4 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms