Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Irx4Q9QY61 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Irx4Q9QY61 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Irx4Q9QY61 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Irx4Q9QY61 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Irx4Q9QY61 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Irx4Q9QY61 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Irx4Q9QY61 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Irx4Q9QY61 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Irx4Q9QY61 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Irx4Q9QY61 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Irx4Q9QY61 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Irx4Q9QY61 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Irx4Q9QY61 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Irx4Q9QY61 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Irx4Q9QY61 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Irx4Q9QY61 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Irx4Q9QY61 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Irx4Q9QY61 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Irx4Q9QY61 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Irx4Q9QY61 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Irx4Q9QY61 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Irx4Q9QY61 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Irx4Q9QY61 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Irx4Q9QY61 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Irx4Q9QY61 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Irx4Q9QY61 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Irx4Q9QY61 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Irx4Q9QY61 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Irx4Q9QY61 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Irx4Q9QY61 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Irx4Q9QY61 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Irx4Q9QY61 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Irx4Q9QY61 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Irx4Q9QY61 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Irx4Q9QY61 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Irx4Q9QY61 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Irx4Q9QY61 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Irx4Q9QY61 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Irx4Q9QY61 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Irx4Q9QY61 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Irx4Q9QY61 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Irx4Q9QY61 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Irx4Q9QY61 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Irx4Q9QY61 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Irx4Q9QY61 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Irx4Q9QY61 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Irx4Q9QY61 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Irx4Q9QY61 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Irx4Q9QY61 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Irx4Q9QY61 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Irx4Q9QY61 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Irx4Q9QY61 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Irx4Q9QY61 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Irx4Q9QY61 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Irx4Q9QY61 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Irx4Q9QY61 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Irx4Q9QY61 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Irx4Q9QY61 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Irx4Q9QY61 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Irx4Q9QY61 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Irx4Q9QY61 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Irx4Q9QY61 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Irx4Q9QY61 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Irx4Q9QY61 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Irx4Q9QY61 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Irx4Q9QY61 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Irx4Q9QY61 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Irx4Q9QY61 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Irx4Q9QY61 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Irx4Q9QY61 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Irx4Q9QY61 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Irx4Q9QY61 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Irx4Q9QY61 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Irx4Q9QY61 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Irx4Q9QY61 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Irx4Q9QY61 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Irx4Q9QY61 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Irx4Q9QY61 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Irx4Q9QY61 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Irx4Q9QY61 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Irx4Q9QY61 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Irx4Q9QY61 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Irx4Q9QY61 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Irx4Q9QY61 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Irx4Q9QY61 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Irx4Q9QY61 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Irx4Q9QY61 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Irx4Q9QY61 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Irx4Q9QY61 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Irx4Q9QY61 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Irx4Q9QY61 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Irx4Q9QY61 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Irx4Q9QY61 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Irx4Q9QY61 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Irx4Q9QY61 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Irx4Q9QY61 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Irx4Q9QY61 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Irx4Q9QY61 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Irx4Q9QY61 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms