Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXW4

Fscn3, Fascin-3, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fscn3Q9QXW4 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Fscn3Q9QXW4 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fscn3Q9QXW4 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fscn3Q9QXW4 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fscn3Q9QXW4 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fscn3Q9QXW4 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fscn3Q9QXW4 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fscn3Q9QXW4 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fscn3Q9QXW4 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fscn3Q9QXW4 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fscn3Q9QXW4 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fscn3Q9QXW4 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fscn3Q9QXW4 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fscn3Q9QXW4 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fscn3Q9QXW4 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fscn3Q9QXW4 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fscn3Q9QXW4 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fscn3Q9QXW4 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Fscn3Q9QXW4 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fscn3Q9QXW4 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fscn3Q9QXW4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fscn3Q9QXW4 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fscn3Q9QXW4 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fscn3Q9QXW4 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fscn3Q9QXW4 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fscn3Q9QXW4 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fscn3Q9QXW4 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fscn3Q9QXW4 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fscn3Q9QXW4 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fscn3Q9QXW4 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fscn3Q9QXW4 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fscn3Q9QXW4 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fscn3Q9QXW4 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fscn3Q9QXW4 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fscn3Q9QXW4 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fscn3Q9QXW4 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fscn3Q9QXW4 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fscn3Q9QXW4 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fscn3Q9QXW4 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fscn3Q9QXW4 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fscn3Q9QXW4 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fscn3Q9QXW4 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Fscn3Q9QXW4 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fscn3Q9QXW4 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fscn3Q9QXW4 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fscn3Q9QXW4 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fscn3Q9QXW4 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fscn3Q9QXW4 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fscn3Q9QXW4 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fscn3Q9QXW4 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fscn3Q9QXW4 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fscn3Q9QXW4 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fscn3Q9QXW4 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fscn3Q9QXW4 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fscn3Q9QXW4 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fscn3Q9QXW4 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fscn3Q9QXW4 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fscn3Q9QXW4 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fscn3Q9QXW4 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fscn3Q9QXW4 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fscn3Q9QXW4 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fscn3Q9QXW4 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fscn3Q9QXW4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fscn3Q9QXW4 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Fscn3Q9QXW4 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fscn3Q9QXW4 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fscn3Q9QXW4 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fscn3Q9QXW4 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fscn3Q9QXW4 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fscn3Q9QXW4 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fscn3Q9QXW4 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fscn3Q9QXW4 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fscn3Q9QXW4 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fscn3Q9QXW4 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fscn3Q9QXW4 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fscn3Q9QXW4 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fscn3Q9QXW4 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fscn3Q9QXW4 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fscn3Q9QXW4 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fscn3Q9QXW4 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fscn3Q9QXW4 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fscn3Q9QXW4 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fscn3Q9QXW4 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Fscn3Q9QXW4 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fscn3Q9QXW4 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Fscn3Q9QXW4 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fscn3Q9QXW4 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fscn3Q9QXW4 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fscn3Q9QXW4 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fscn3Q9QXW4 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fscn3Q9QXW4 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fscn3Q9QXW4 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fscn3Q9QXW4 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fscn3Q9QXW4 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fscn3Q9QXW4 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fscn3Q9QXW4 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fscn3Q9QXW4 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Fscn3Q9QXW4 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fscn3Q9QXW4 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fscn3Q9QXW4 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms