Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXN3

Trip4, Activating signal cointegrator 1, mousemouse

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip4Q9QXN3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trip4Q9QXN3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Trip4Q9QXN3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Trip4Q9QXN3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trip4Q9QXN3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trip4Q9QXN3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trip4Q9QXN3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trip4Q9QXN3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trip4Q9QXN3 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trip4Q9QXN3 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trip4Q9QXN3 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trip4Q9QXN3 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trip4Q9QXN3 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trip4Q9QXN3 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trip4Q9QXN3 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trip4Q9QXN3 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trip4Q9QXN3 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trip4Q9QXN3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trip4Q9QXN3 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Trip4Q9QXN3 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms