Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ChmQ9QXG2 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ChmQ9QXG2 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ChmQ9QXG2 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ChmQ9QXG2 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ChmQ9QXG2 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ChmQ9QXG2 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ChmQ9QXG2 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ChmQ9QXG2 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ChmQ9QXG2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ChmQ9QXG2 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ChmQ9QXG2 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ChmQ9QXG2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ChmQ9QXG2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ChmQ9QXG2 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ChmQ9QXG2 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ChmQ9QXG2 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ChmQ9QXG2 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ChmQ9QXG2 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ChmQ9QXG2 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ChmQ9QXG2 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ChmQ9QXG2 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ChmQ9QXG2 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ChmQ9QXG2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ChmQ9QXG2 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ChmQ9QXG2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ChmQ9QXG2 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ChmQ9QXG2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ChmQ9QXG2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ChmQ9QXG2 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ChmQ9QXG2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ChmQ9QXG2 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ChmQ9QXG2 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ChmQ9QXG2 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ChmQ9QXG2 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ChmQ9QXG2 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ChmQ9QXG2 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ChmQ9QXG2 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ChmQ9QXG2 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ChmQ9QXG2 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ChmQ9QXG2 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ChmQ9QXG2 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ChmQ9QXG2 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ChmQ9QXG2 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ChmQ9QXG2 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ChmQ9QXG2 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ChmQ9QXG2 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ChmQ9QXG2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ChmQ9QXG2 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ChmQ9QXG2 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ChmQ9QXG2 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ChmQ9QXG2 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ChmQ9QXG2 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ChmQ9QXG2 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ChmQ9QXG2 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ChmQ9QXG2 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ChmQ9QXG2 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ChmQ9QXG2 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ChmQ9QXG2 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ChmQ9QXG2 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
ChmQ9QXG2 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ChmQ9QXG2 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ChmQ9QXG2 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ChmQ9QXG2 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ChmQ9QXG2 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ChmQ9QXG2 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ChmQ9QXG2 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ChmQ9QXG2 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ChmQ9QXG2 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
ChmQ9QXG2 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
ChmQ9QXG2 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
ChmQ9QXG2 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
ChmQ9QXG2 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ChmQ9QXG2 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ChmQ9QXG2 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ChmQ9QXG2 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ChmQ9QXG2 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ChmQ9QXG2 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ChmQ9QXG2 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ChmQ9QXG2 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ChmQ9QXG2 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ChmQ9QXG2 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
ChmQ9QXG2 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
ChmQ9QXG2 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
ChmQ9QXG2 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
ChmQ9QXG2 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
ChmQ9QXG2 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ChmQ9QXG2 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ChmQ9QXG2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ChmQ9QXG2 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ChmQ9QXG2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
ChmQ9QXG2 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ChmQ9QXG2 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ChmQ9QXG2 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ChmQ9QXG2 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ChmQ9QXG2 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ChmQ9QXG2 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ChmQ9QXG2 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ChmQ9QXG2 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ChmQ9QXG2 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms