Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE4

Trp53inp1, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53inp1Q9QXE4 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trp53inp1Q9QXE4 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trp53inp1Q9QXE4 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trp53inp1Q9QXE4 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trp53inp1Q9QXE4 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trp53inp1Q9QXE4 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trp53inp1Q9QXE4 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trp53inp1Q9QXE4 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trp53inp1Q9QXE4 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trp53inp1Q9QXE4 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trp53inp1Q9QXE4 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trp53inp1Q9QXE4 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trp53inp1Q9QXE4 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trp53inp1Q9QXE4 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trp53inp1Q9QXE4 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trp53inp1Q9QXE4 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trp53inp1Q9QXE4 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trp53inp1Q9QXE4 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trp53inp1Q9QXE4 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trp53inp1Q9QXE4 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trp53inp1Q9QXE4 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trp53inp1Q9QXE4 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trp53inp1Q9QXE4 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trp53inp1Q9QXE4 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trp53inp1Q9QXE4 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trp53inp1Q9QXE4 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trp53inp1Q9QXE4 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trp53inp1Q9QXE4 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trp53inp1Q9QXE4 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trp53inp1Q9QXE4 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trp53inp1Q9QXE4 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trp53inp1Q9QXE4 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trp53inp1Q9QXE4 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trp53inp1Q9QXE4 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trp53inp1Q9QXE4 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trp53inp1Q9QXE4 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trp53inp1Q9QXE4 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trp53inp1Q9QXE4 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trp53inp1Q9QXE4 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trp53inp1Q9QXE4 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trp53inp1Q9QXE4 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trp53inp1Q9QXE4 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trp53inp1Q9QXE4 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trp53inp1Q9QXE4 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trp53inp1Q9QXE4 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trp53inp1Q9QXE4 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trp53inp1Q9QXE4 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trp53inp1Q9QXE4 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trp53inp1Q9QXE4 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trp53inp1Q9QXE4 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Trp53inp1Q9QXE4 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Trp53inp1Q9QXE4 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trp53inp1Q9QXE4 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trp53inp1Q9QXE4 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trp53inp1Q9QXE4 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trp53inp1Q9QXE4 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trp53inp1Q9QXE4 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trp53inp1Q9QXE4 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trp53inp1Q9QXE4 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trp53inp1Q9QXE4 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trp53inp1Q9QXE4 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trp53inp1Q9QXE4 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trp53inp1Q9QXE4 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trp53inp1Q9QXE4 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trp53inp1Q9QXE4 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trp53inp1Q9QXE4 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trp53inp1Q9QXE4 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Trp53inp1Q9QXE4 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trp53inp1Q9QXE4 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trp53inp1Q9QXE4 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trp53inp1Q9QXE4 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trp53inp1Q9QXE4 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trp53inp1Q9QXE4 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trp53inp1Q9QXE4 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Trp53inp1Q9QXE4 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Trp53inp1Q9QXE4 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Trp53inp1Q9QXE4 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Trp53inp1Q9QXE4 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trp53inp1Q9QXE4 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Trp53inp1Q9QXE4 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trp53inp1Q9QXE4 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trp53inp1Q9QXE4 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trp53inp1Q9QXE4 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trp53inp1Q9QXE4 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trp53inp1Q9QXE4 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trp53inp1Q9QXE4 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trp53inp1Q9QXE4 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trp53inp1Q9QXE4 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trp53inp1Q9QXE4 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trp53inp1Q9QXE4 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trp53inp1Q9QXE4 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trp53inp1Q9QXE4 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trp53inp1Q9QXE4 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Trp53inp1Q9QXE4 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trp53inp1Q9QXE4 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trp53inp1Q9QXE4 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Trp53inp1Q9QXE4 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trp53inp1Q9QXE4 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trp53inp1Q9QXE4 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trp53inp1Q9QXE4 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms