Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim44Q9QXA7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim44Q9QXA7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim44Q9QXA7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim44Q9QXA7 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim44Q9QXA7 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim44Q9QXA7 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim44Q9QXA7 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim44Q9QXA7 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim44Q9QXA7 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim44Q9QXA7 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim44Q9QXA7 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim44Q9QXA7 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim44Q9QXA7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim44Q9QXA7 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim44Q9QXA7 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim44Q9QXA7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim44Q9QXA7 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim44Q9QXA7 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim44Q9QXA7 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim44Q9QXA7 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim44Q9QXA7 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim44Q9QXA7 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim44Q9QXA7 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim44Q9QXA7 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim44Q9QXA7 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim44Q9QXA7 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim44Q9QXA7 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim44Q9QXA7 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim44Q9QXA7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim44Q9QXA7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim44Q9QXA7 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim44Q9QXA7 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim44Q9QXA7 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim44Q9QXA7 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim44Q9QXA7 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim44Q9QXA7 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim44Q9QXA7 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim44Q9QXA7 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim44Q9QXA7 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Trim44Q9QXA7 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim44Q9QXA7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim44Q9QXA7 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim44Q9QXA7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim44Q9QXA7 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim44Q9QXA7 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim44Q9QXA7 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim44Q9QXA7 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim44Q9QXA7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim44Q9QXA7 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim44Q9QXA7 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim44Q9QXA7 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim44Q9QXA7 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim44Q9QXA7 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim44Q9QXA7 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim44Q9QXA7 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim44Q9QXA7 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim44Q9QXA7 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim44Q9QXA7 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim44Q9QXA7 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim44Q9QXA7 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim44Q9QXA7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim44Q9QXA7 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim44Q9QXA7 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim44Q9QXA7 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim44Q9QXA7 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim44Q9QXA7 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim44Q9QXA7 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim44Q9QXA7 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim44Q9QXA7 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim44Q9QXA7 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim44Q9QXA7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim44Q9QXA7 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim44Q9QXA7 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim44Q9QXA7 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim44Q9QXA7 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim44Q9QXA7 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim44Q9QXA7 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim44Q9QXA7 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim44Q9QXA7 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim44Q9QXA7 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim44Q9QXA7 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim44Q9QXA7 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim44Q9QXA7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim44Q9QXA7 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim44Q9QXA7 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim44Q9QXA7 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim44Q9QXA7 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim44Q9QXA7 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim44Q9QXA7 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim44Q9QXA7 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim44Q9QXA7 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim44Q9QXA7 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim44Q9QXA7 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim44Q9QXA7 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim44Q9QXA7 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim44Q9QXA7 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim44Q9QXA7 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim44Q9QXA7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim44Q9QXA7 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms