Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX15

Clca3a1, Calcium-activated chloride channel regulator 3A-1, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3a1Q9QX15 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Clca3a1Q9QX15 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clca3a1Q9QX15 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clca3a1Q9QX15 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clca3a1Q9QX15 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clca3a1Q9QX15 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clca3a1Q9QX15 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clca3a1Q9QX15 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clca3a1Q9QX15 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clca3a1Q9QX15 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clca3a1Q9QX15 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Clca3a1Q9QX15 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clca3a1Q9QX15 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clca3a1Q9QX15 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clca3a1Q9QX15 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clca3a1Q9QX15 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Clca3a1Q9QX15 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clca3a1Q9QX15 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clca3a1Q9QX15 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clca3a1Q9QX15 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clca3a1Q9QX15 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clca3a1Q9QX15 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clca3a1Q9QX15 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clca3a1Q9QX15 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clca3a1Q9QX15 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clca3a1Q9QX15 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clca3a1Q9QX15 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clca3a1Q9QX15 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clca3a1Q9QX15 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clca3a1Q9QX15 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clca3a1Q9QX15 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Clca3a1Q9QX15 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clca3a1Q9QX15 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clca3a1Q9QX15 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clca3a1Q9QX15 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clca3a1Q9QX15 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clca3a1Q9QX15 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clca3a1Q9QX15 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clca3a1Q9QX15 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Clca3a1Q9QX15 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clca3a1Q9QX15 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Clca3a1Q9QX15 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clca3a1Q9QX15 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clca3a1Q9QX15 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clca3a1Q9QX15 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clca3a1Q9QX15 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clca3a1Q9QX15 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clca3a1Q9QX15 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clca3a1Q9QX15 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clca3a1Q9QX15 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Clca3a1Q9QX15 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Clca3a1Q9QX15 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clca3a1Q9QX15 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clca3a1Q9QX15 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clca3a1Q9QX15 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clca3a1Q9QX15 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clca3a1Q9QX15 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clca3a1Q9QX15 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clca3a1Q9QX15 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clca3a1Q9QX15 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Clca3a1Q9QX15 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Clca3a1Q9QX15 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Clca3a1Q9QX15 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Clca3a1Q9QX15 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Clca3a1Q9QX15 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Clca3a1Q9QX15 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Clca3a1Q9QX15 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clca3a1Q9QX15 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clca3a1Q9QX15 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Clca3a1Q9QX15 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Clca3a1Q9QX15 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clca3a1Q9QX15 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Clca3a1Q9QX15 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clca3a1Q9QX15 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clca3a1Q9QX15 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clca3a1Q9QX15 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clca3a1Q9QX15 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clca3a1Q9QX15 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clca3a1Q9QX15 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clca3a1Q9QX15 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clca3a1Q9QX15 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clca3a1Q9QX15 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clca3a1Q9QX15 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clca3a1Q9QX15 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clca3a1Q9QX15 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clca3a1Q9QX15 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Clca3a1Q9QX15 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clca3a1Q9QX15 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clca3a1Q9QX15 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Clca3a1Q9QX15 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clca3a1Q9QX15 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Clca3a1Q9QX15 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clca3a1Q9QX15 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clca3a1Q9QX15 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clca3a1Q9QX15 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clca3a1Q9QX15 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Clca3a1Q9QX15 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clca3a1Q9QX15 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clca3a1Q9QX15 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Clca3a1Q9QX15 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms