Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVY8

Rai2, Retinoic acid-induced protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai2Q9QVY8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rai2Q9QVY8 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rai2Q9QVY8 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rai2Q9QVY8 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rai2Q9QVY8 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rai2Q9QVY8 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rai2Q9QVY8 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rai2Q9QVY8 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rai2Q9QVY8 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rai2Q9QVY8 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rai2Q9QVY8 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rai2Q9QVY8 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rai2Q9QVY8 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rai2Q9QVY8 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rai2Q9QVY8 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Rai2Q9QVY8 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rai2Q9QVY8 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rai2Q9QVY8 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rai2Q9QVY8 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rai2Q9QVY8 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rai2Q9QVY8 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rai2Q9QVY8 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rai2Q9QVY8 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Rai2Q9QVY8 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rai2Q9QVY8 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rai2Q9QVY8 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rai2Q9QVY8 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rai2Q9QVY8 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rai2Q9QVY8 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rai2Q9QVY8 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rai2Q9QVY8 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rai2Q9QVY8 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rai2Q9QVY8 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rai2Q9QVY8 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rai2Q9QVY8 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Rai2Q9QVY8 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Rai2Q9QVY8 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rai2Q9QVY8 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rai2Q9QVY8 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rai2Q9QVY8 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rai2Q9QVY8 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rai2Q9QVY8 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rai2Q9QVY8 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rai2Q9QVY8 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rai2Q9QVY8 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rai2Q9QVY8 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rai2Q9QVY8 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rai2Q9QVY8 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rai2Q9QVY8 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rai2Q9QVY8 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rai2Q9QVY8 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rai2Q9QVY8 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rai2Q9QVY8 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rai2Q9QVY8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rai2Q9QVY8 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rai2Q9QVY8 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Rai2Q9QVY8 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rai2Q9QVY8 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rai2Q9QVY8 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Rai2Q9QVY8 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rai2Q9QVY8 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rai2Q9QVY8 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rai2Q9QVY8 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rai2Q9QVY8 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rai2Q9QVY8 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rai2Q9QVY8 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rai2Q9QVY8 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rai2Q9QVY8 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rai2Q9QVY8 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rai2Q9QVY8 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Rai2Q9QVY8 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rai2Q9QVY8 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rai2Q9QVY8 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rai2Q9QVY8 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rai2Q9QVY8 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rai2Q9QVY8 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rai2Q9QVY8 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rai2Q9QVY8 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rai2Q9QVY8 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rai2Q9QVY8 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rai2Q9QVY8 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rai2Q9QVY8 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rai2Q9QVY8 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Rai2Q9QVY8 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rai2Q9QVY8 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Rai2Q9QVY8 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Rai2Q9QVY8 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rai2Q9QVY8 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rai2Q9QVY8 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rai2Q9QVY8 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rai2Q9QVY8 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rai2Q9QVY8 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rai2Q9QVY8 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rai2Q9QVY8 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rai2Q9QVY8 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rai2Q9QVY8 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rai2Q9QVY8 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rai2Q9QVY8 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rai2Q9QVY8 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Rai2Q9QVY8 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms