Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG7

Hdgfl3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl3Q9JMG7 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hdgfl3Q9JMG7 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Hdgfl3Q9JMG7 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Hdgfl3Q9JMG7 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Hdgfl3Q9JMG7 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hdgfl3Q9JMG7 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms