Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLL0

Crim1, Cysteine-rich motor neuron 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crim1Q9JLL0 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Crim1Q9JLL0 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Crim1Q9JLL0 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Crim1Q9JLL0 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Crim1Q9JLL0 Gm11008-201ENSMUST00000109032 622 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Crim1Q9JLL0 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Crim1Q9JLL0 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Crim1Q9JLL0 4933416E03Rik-201ENSMUST00000133091 1126 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Crim1Q9JLL0 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Crim1Q9JLL0 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Crim1Q9JLL0 Gm17066-202ENSMUST00000165350 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Crim1Q9JLL0 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Crim1Q9JLL0 Gm45359-201ENSMUST00000210635 427 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Crim1Q9JLL0 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Crim1Q9JLL0 AC125539.1-201ENSMUST00000227423 622 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Crim1Q9JLL0 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Crim1Q9JLL0 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Crim1Q9JLL0 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Crim1Q9JLL0 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Crim1Q9JLL0 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Crim1Q9JLL0 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Crim1Q9JLL0 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Crim1Q9JLL0 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Crim1Q9JLL0 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Crim1Q9JLL0 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Crim1Q9JLL0 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Crim1Q9JLL0 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Crim1Q9JLL0 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Crim1Q9JLL0 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Crim1Q9JLL0 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Crim1Q9JLL0 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Crim1Q9JLL0 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Crim1Q9JLL0 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Crim1Q9JLL0 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Crim1Q9JLL0 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Crim1Q9JLL0 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Crim1Q9JLL0 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Crim1Q9JLL0 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Crim1Q9JLL0 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Crim1Q9JLL0 Esp36-201ENSMUST00000172814 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Crim1Q9JLL0 Esp36-202ENSMUST00000177882 1117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Crim1Q9JLL0 Gm20854-201ENSMUST00000178889 1002 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Crim1Q9JLL0 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Crim1Q9JLL0 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Crim1Q9JLL0 AC154252.1-201ENSMUST00000226041 473 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Crim1Q9JLL0 Sult1e1-201ENSMUST00000031201 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Crim1Q9JLL0 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Crim1Q9JLL0 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Crim1Q9JLL0 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Crim1Q9JLL0 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Crim1Q9JLL0 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Crim1Q9JLL0 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Crim1Q9JLL0 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Crim1Q9JLL0 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Crim1Q9JLL0 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Crim1Q9JLL0 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Crim1Q9JLL0 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Crim1Q9JLL0 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Crim1Q9JLL0 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Crim1Q9JLL0 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Crim1Q9JLL0 Gm29747-201ENSMUST00000194764 585 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Crim1Q9JLL0 Gm42474-201ENSMUST00000201073 505 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Crim1Q9JLL0 Ly96-201ENSMUST00000026881 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Crim1Q9JLL0 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Crim1Q9JLL0 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Crim1Q9JLL0 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Crim1Q9JLL0 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Crim1Q9JLL0 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Crim1Q9JLL0 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Crim1Q9JLL0 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Crim1Q9JLL0 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Crim1Q9JLL0 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Crim1Q9JLL0 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Crim1Q9JLL0 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Crim1Q9JLL0 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Crim1Q9JLL0 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Crim1Q9JLL0 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Crim1Q9JLL0 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Crim1Q9JLL0 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Crim1Q9JLL0 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Crim1Q9JLL0 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Crim1Q9JLL0 Defb30-202ENSMUST00000111207 989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Crim1Q9JLL0 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Crim1Q9JLL0 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Crim1Q9JLL0 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Crim1Q9JLL0 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Crim1Q9JLL0 Gm4265-201ENSMUST00000206701 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Crim1Q9JLL0 Gm44785-201ENSMUST00000207379 620 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Crim1Q9JLL0 Gm19540-201ENSMUST00000221843 810 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Crim1Q9JLL0 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Crim1Q9JLL0 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Crim1Q9JLL0 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Crim1Q9JLL0 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Crim1Q9JLL0 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Crim1Q9JLL0 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Crim1Q9JLL0 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crim1Q9JLL0 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crim1Q9JLL0 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crim1Q9JLL0 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crim1Q9JLL0 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms