Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK7

Cabp1, Calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp1Q9JLK7 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cabp1Q9JLK7 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Cabp1Q9JLK7 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Cabp1Q9JLK7 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Cabp1Q9JLK7 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Cabp1Q9JLK7 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cabp1Q9JLK7 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cabp1Q9JLK7 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cabp1Q9JLK7 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Cabp1Q9JLK7 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cabp1Q9JLK7 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cabp1Q9JLK7 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cabp1Q9JLK7 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cabp1Q9JLK7 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cabp1Q9JLK7 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cabp1Q9JLK7 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cabp1Q9JLK7 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cabp1Q9JLK7 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Cabp1Q9JLK7 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cabp1Q9JLK7 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cabp1Q9JLK7 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cabp1Q9JLK7 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cabp1Q9JLK7 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Cabp1Q9JLK7 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cabp1Q9JLK7 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cabp1Q9JLK7 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cabp1Q9JLK7 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cabp1Q9JLK7 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cabp1Q9JLK7 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cabp1Q9JLK7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cabp1Q9JLK7 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Cabp1Q9JLK7 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cabp1Q9JLK7 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cabp1Q9JLK7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cabp1Q9JLK7 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cabp1Q9JLK7 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cabp1Q9JLK7 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cabp1Q9JLK7 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cabp1Q9JLK7 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Cabp1Q9JLK7 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cabp1Q9JLK7 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cabp1Q9JLK7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cabp1Q9JLK7 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cabp1Q9JLK7 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cabp1Q9JLK7 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cabp1Q9JLK7 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cabp1Q9JLK7 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cabp1Q9JLK7 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cabp1Q9JLK7 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cabp1Q9JLK7 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cabp1Q9JLK7 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cabp1Q9JLK7 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cabp1Q9JLK7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cabp1Q9JLK7 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cabp1Q9JLK7 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cabp1Q9JLK7 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cabp1Q9JLK7 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cabp1Q9JLK7 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cabp1Q9JLK7 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cabp1Q9JLK7 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cabp1Q9JLK7 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cabp1Q9JLK7 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cabp1Q9JLK7 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cabp1Q9JLK7 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cabp1Q9JLK7 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cabp1Q9JLK7 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cabp1Q9JLK7 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cabp1Q9JLK7 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cabp1Q9JLK7 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cabp1Q9JLK7 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cabp1Q9JLK7 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cabp1Q9JLK7 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cabp1Q9JLK7 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cabp1Q9JLK7 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cabp1Q9JLK7 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cabp1Q9JLK7 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cabp1Q9JLK7 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cabp1Q9JLK7 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cabp1Q9JLK7 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cabp1Q9JLK7 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cabp1Q9JLK7 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cabp1Q9JLK7 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cabp1Q9JLK7 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cabp1Q9JLK7 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cabp1Q9JLK7 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cabp1Q9JLK7 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cabp1Q9JLK7 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cabp1Q9JLK7 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cabp1Q9JLK7 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cabp1Q9JLK7 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cabp1Q9JLK7 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cabp1Q9JLK7 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cabp1Q9JLK7 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cabp1Q9JLK7 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cabp1Q9JLK7 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cabp1Q9JLK7 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Cabp1Q9JLK7 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cabp1Q9JLK7 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cabp1Q9JLK7 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cabp1Q9JLK7 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms