Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC8

Sacs, Sacsin, mousemouse

Predictions only

Length 4,582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SacsQ9JLC8 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms