Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKV5

Scamp4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp4Q9JKV5 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Scamp4Q9JKV5 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Scamp4Q9JKV5 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Scamp4Q9JKV5 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Scamp4Q9JKV5 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Scamp4Q9JKV5 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Scamp4Q9JKV5 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scamp4Q9JKV5 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scamp4Q9JKV5 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scamp4Q9JKV5 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scamp4Q9JKV5 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scamp4Q9JKV5 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scamp4Q9JKV5 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scamp4Q9JKV5 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scamp4Q9JKV5 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scamp4Q9JKV5 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scamp4Q9JKV5 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scamp4Q9JKV5 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scamp4Q9JKV5 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scamp4Q9JKV5 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scamp4Q9JKV5 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scamp4Q9JKV5 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scamp4Q9JKV5 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scamp4Q9JKV5 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scamp4Q9JKV5 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Scamp4Q9JKV5 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms