Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ldb3Q9JKS4 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ldb3Q9JKS4 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ldb3Q9JKS4 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ldb3Q9JKS4 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ldb3Q9JKS4 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ldb3Q9JKS4 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ldb3Q9JKS4 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ldb3Q9JKS4 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ldb3Q9JKS4 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ldb3Q9JKS4 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ldb3Q9JKS4 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ldb3Q9JKS4 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ldb3Q9JKS4 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ldb3Q9JKS4 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ldb3Q9JKS4 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ldb3Q9JKS4 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ldb3Q9JKS4 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ldb3Q9JKS4 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ldb3Q9JKS4 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ldb3Q9JKS4 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ldb3Q9JKS4 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ldb3Q9JKS4 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ldb3Q9JKS4 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ldb3Q9JKS4 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ldb3Q9JKS4 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ldb3Q9JKS4 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ldb3Q9JKS4 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ldb3Q9JKS4 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ldb3Q9JKS4 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ldb3Q9JKS4 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ldb3Q9JKS4 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ldb3Q9JKS4 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ldb3Q9JKS4 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ldb3Q9JKS4 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ldb3Q9JKS4 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ldb3Q9JKS4 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ldb3Q9JKS4 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ldb3Q9JKS4 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ldb3Q9JKS4 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ldb3Q9JKS4 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ldb3Q9JKS4 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ldb3Q9JKS4 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ldb3Q9JKS4 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ldb3Q9JKS4 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ldb3Q9JKS4 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ldb3Q9JKS4 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ldb3Q9JKS4 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ldb3Q9JKS4 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ldb3Q9JKS4 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ldb3Q9JKS4 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ldb3Q9JKS4 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ldb3Q9JKS4 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ldb3Q9JKS4 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ldb3Q9JKS4 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ldb3Q9JKS4 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ldb3Q9JKS4 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ldb3Q9JKS4 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ldb3Q9JKS4 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ldb3Q9JKS4 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ldb3Q9JKS4 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ldb3Q9JKS4 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ldb3Q9JKS4 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ldb3Q9JKS4 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ldb3Q9JKS4 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ldb3Q9JKS4 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ldb3Q9JKS4 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ldb3Q9JKS4 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ldb3Q9JKS4 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ldb3Q9JKS4 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ldb3Q9JKS4 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ldb3Q9JKS4 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ldb3Q9JKS4 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ldb3Q9JKS4 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ldb3Q9JKS4 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ldb3Q9JKS4 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ldb3Q9JKS4 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ldb3Q9JKS4 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ldb3Q9JKS4 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ldb3Q9JKS4 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ldb3Q9JKS4 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ldb3Q9JKS4 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ldb3Q9JKS4 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ldb3Q9JKS4 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ldb3Q9JKS4 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ldb3Q9JKS4 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ldb3Q9JKS4 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ldb3Q9JKS4 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ldb3Q9JKS4 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ldb3Q9JKS4 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ldb3Q9JKS4 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ldb3Q9JKS4 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ldb3Q9JKS4 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ldb3Q9JKS4 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ldb3Q9JKS4 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ldb3Q9JKS4 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ldb3Q9JKS4 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ldb3Q9JKS4 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ldb3Q9JKS4 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ldb3Q9JKS4 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms