Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP7

Pole3, DNA polymerase epsilon subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole3Q9JKP7 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pole3Q9JKP7 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pole3Q9JKP7 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pole3Q9JKP7 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pole3Q9JKP7 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pole3Q9JKP7 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pole3Q9JKP7 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pole3Q9JKP7 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pole3Q9JKP7 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pole3Q9JKP7 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pole3Q9JKP7 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pole3Q9JKP7 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pole3Q9JKP7 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pole3Q9JKP7 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pole3Q9JKP7 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pole3Q9JKP7 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pole3Q9JKP7 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pole3Q9JKP7 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pole3Q9JKP7 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pole3Q9JKP7 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pole3Q9JKP7 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pole3Q9JKP7 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pole3Q9JKP7 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pole3Q9JKP7 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pole3Q9JKP7 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pole3Q9JKP7 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pole3Q9JKP7 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pole3Q9JKP7 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pole3Q9JKP7 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pole3Q9JKP7 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pole3Q9JKP7 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pole3Q9JKP7 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pole3Q9JKP7 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pole3Q9JKP7 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pole3Q9JKP7 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pole3Q9JKP7 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pole3Q9JKP7 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pole3Q9JKP7 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pole3Q9JKP7 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pole3Q9JKP7 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pole3Q9JKP7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pole3Q9JKP7 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pole3Q9JKP7 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pole3Q9JKP7 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pole3Q9JKP7 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pole3Q9JKP7 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pole3Q9JKP7 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pole3Q9JKP7 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pole3Q9JKP7 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pole3Q9JKP7 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pole3Q9JKP7 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms