Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKN6

Nova1, RNA-binding protein Nova-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nova1Q9JKN6 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nova1Q9JKN6 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nova1Q9JKN6 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nova1Q9JKN6 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Nova1Q9JKN6 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Nova1Q9JKN6 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nova1Q9JKN6 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nova1Q9JKN6 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nova1Q9JKN6 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nova1Q9JKN6 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nova1Q9JKN6 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nova1Q9JKN6 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nova1Q9JKN6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nova1Q9JKN6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nova1Q9JKN6 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nova1Q9JKN6 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nova1Q9JKN6 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nova1Q9JKN6 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nova1Q9JKN6 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nova1Q9JKN6 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nova1Q9JKN6 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nova1Q9JKN6 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Nova1Q9JKN6 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nova1Q9JKN6 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nova1Q9JKN6 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nova1Q9JKN6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nova1Q9JKN6 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nova1Q9JKN6 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nova1Q9JKN6 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nova1Q9JKN6 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nova1Q9JKN6 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nova1Q9JKN6 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nova1Q9JKN6 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nova1Q9JKN6 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nova1Q9JKN6 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nova1Q9JKN6 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nova1Q9JKN6 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nova1Q9JKN6 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nova1Q9JKN6 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nova1Q9JKN6 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nova1Q9JKN6 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nova1Q9JKN6 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nova1Q9JKN6 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nova1Q9JKN6 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nova1Q9JKN6 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nova1Q9JKN6 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nova1Q9JKN6 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nova1Q9JKN6 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nova1Q9JKN6 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nova1Q9JKN6 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nova1Q9JKN6 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nova1Q9JKN6 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nova1Q9JKN6 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nova1Q9JKN6 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nova1Q9JKN6 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nova1Q9JKN6 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nova1Q9JKN6 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nova1Q9JKN6 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nova1Q9JKN6 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nova1Q9JKN6 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nova1Q9JKN6 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nova1Q9JKN6 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nova1Q9JKN6 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nova1Q9JKN6 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nova1Q9JKN6 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nova1Q9JKN6 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nova1Q9JKN6 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nova1Q9JKN6 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nova1Q9JKN6 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nova1Q9JKN6 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nova1Q9JKN6 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nova1Q9JKN6 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nova1Q9JKN6 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nova1Q9JKN6 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nova1Q9JKN6 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nova1Q9JKN6 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nova1Q9JKN6 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nova1Q9JKN6 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nova1Q9JKN6 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nova1Q9JKN6 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nova1Q9JKN6 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nova1Q9JKN6 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nova1Q9JKN6 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nova1Q9JKN6 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nova1Q9JKN6 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nova1Q9JKN6 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nova1Q9JKN6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nova1Q9JKN6 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nova1Q9JKN6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nova1Q9JKN6 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nova1Q9JKN6 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nova1Q9JKN6 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nova1Q9JKN6 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nova1Q9JKN6 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nova1Q9JKN6 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nova1Q9JKN6 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nova1Q9JKN6 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nova1Q9JKN6 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nova1Q9JKN6 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nova1Q9JKN6 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms